92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2020 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  82.29 
 
 		 93 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  45.92 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  49.32 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2022  hypothetical protein  45.92 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  43.06 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  49.32 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  38.95 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  46.48 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  48.57 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  40.86 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  36.78 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  42.17 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  41.57 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  36.96 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  38.27 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  45.31 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  45.31 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  41.18 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  38.89 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  41.54 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  37.88 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  39.13 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  38.75 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  38.57 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  37.18 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  37.5 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  44.64 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  47.06 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  44.68 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  31.08 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  38.67 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  45.24 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  38.89 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  32.35 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  32.26 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  36.07 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  38.36 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  35.9 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  44.19 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  30.14 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  32.31 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  44.19 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  36.17 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  44.19 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  43.18 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  47.5 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  37.63 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  40.91 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  44.19 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  34.29 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  29.63 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  38.1 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  32.31 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  37.33 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  38.81 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  45.24 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  25.58 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  37.14 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3797  hypothetical protein  34.38 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  43.9 
 
 		 69 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  38.64 
 
 		 138 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  31.67 
 
 		 75 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  40.48 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  39.53 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  28 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  27.69 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  47.83 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  31.75 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  39.53 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  39.39 
 
 		 137 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>