More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0126 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  68.29 
 
 		 225 aa  296  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  68.14 
 
 		 225 aa  291  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  49.49 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  47.26 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  50 
 
 		 218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  48.76 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  50.27 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  48.76 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  44.61 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  43.36 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.78 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  44.85 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  42.18 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.94 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  47.94 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  47.59 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  47.94 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  47.59 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 260 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.5 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  46.86 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  42.25 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  41.87 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 211 aa  158  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  47.5 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 204 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  46.81 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  45.15 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  43.69 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  46.12 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  41.63 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  42.18 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  40.38 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  40.38 
 
 		 213 aa  151  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  43.01 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  43.2 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  43.4 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  41.63 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 233 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  38.89 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  43.22 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  40 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  42 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  42 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  39.72 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  42 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  42 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  42 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  42 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  38.35 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  40 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  37.68 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  37.2 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  39.63 
 
 		 221 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  41.5 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  43.2 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  40.51 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 252 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  39.23 
 
 		 206 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  41.5 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  40 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  46.67 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  40.29 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>