65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3628 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  490  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  72.24 
 
 		 246 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  65.22 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  56.18 
 
 		 122 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  50.5 
 
 		 1698 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  60.26 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  62.5 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  50.57 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  54.76 
 
 		 207 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  69.35 
 
 		 265 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  53.57 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  56.79 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  52.94 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  55.95 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  59.49 
 
 		 371 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  39.35 
 
 		 338 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  57.32 
 
 		 332 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  41.48 
 
 		 322 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  53.66 
 
 		 316 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  64.52 
 
 		 401 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  55.56 
 
 		 363 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  42.86 
 
 		 359 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  60 
 
 		 328 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  49.43 
 
 		 378 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  54.76 
 
 		 1578 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  47.46 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  51.85 
 
 		 313 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  53.75 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  54.88 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  46.15 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  50 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  52.87 
 
 		 1632 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  53.85 
 
 		 274 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  51.81 
 
 		 982 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  55.84 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  39.22 
 
 		 344 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  55.56 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  40.94 
 
 		 1682 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  50.57 
 
 		 380 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  53.16 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  40 
 
 		 348 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  47.83 
 
 		 352 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  52.94 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  56.52 
 
 		 376 aa  85.5  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  51.14 
 
 		 1669 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  55 
 
 		 1562 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  50.62 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  48.28 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  51.81 
 
 		 1559 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  51.25 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  35.42 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  50.63 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  50.63 
 
 		 1689 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  48.1 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  45.65 
 
 		 1723 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  46.99 
 
 		 1658 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  27.65 
 
 		 2277 aa  49.3  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  37.5 
 
 		 1381 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  36.14 
 
 		 1840 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  32.56 
 
 		 869 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  45.65 
 
 		 1338 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  39.13 
 
 		 1433 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  35.06 
 
 		 520 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  39.53 
 
 		 738 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>