More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3272 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  55.03 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 181 aa  91.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  37.24 
 
 		 172 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  34.78 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 		 191 aa  87  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 174 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  37.61 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  33.33 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  34.29 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  35.78 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  32.14 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  29.25 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  28.67 
 
 		 167 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  32.84 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2164  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  31.45 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  43.42 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.37 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1154  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  38.82 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  38.82 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  38.82 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>