More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1530 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  100 
 
 		 345 aa  682    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  73.63 
 
 		 345 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  63.89 
 
 		 342 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  58.58 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0921  membrane protein  62.54 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  56.34 
 
 		 340 aa  335  7.999999999999999e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.555245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  43.95 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 377 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  37.39 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  36.98 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 362 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  33.43 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 528 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  35.23 
 
 		 344 aa  158  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 377 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  36 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  32.94 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  33.82 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.14 
 
 		 364 aa  152  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 352 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 392 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6452  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 400 aa  145  7.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 364 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  30.52 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 380 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 363 aa  143  6e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 		 352 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 356 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.94 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 379 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.4 
 
 		 349 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.56 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.59 
 
 		 471 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1415  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 448 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 410 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  32.94 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  32.94 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  32.94 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1314  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.725707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0917  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 351 aa  126  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 347 aa  125  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  28.2 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 451 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4401  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 351 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  35.1 
 
 		 349 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>