More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0921 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0921  membrane protein  100 
 
 
339 aa  659    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  62.54 
 
 
345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  64.95 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  60.49 
 
 
342 aa  359  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  55.39 
 
 
338 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  56.34 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.555245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  44.85 
 
 
340 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  37.2 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  36.09 
 
 
372 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  35.06 
 
 
391 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  35.91 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  35.03 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  35.03 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  35.54 
 
 
365 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  36.02 
 
 
354 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  36.02 
 
 
354 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
364 aa  166  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  32.14 
 
 
377 aa  162  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  32.84 
 
 
373 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  35.78 
 
 
364 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  35.61 
 
 
362 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  33.23 
 
 
360 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  35.63 
 
 
371 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  36.48 
 
 
344 aa  155  8e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.02 
 
 
352 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  30.65 
 
 
372 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  35.78 
 
 
364 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  33.03 
 
 
367 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  32.33 
 
 
376 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  35.43 
 
 
392 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
365 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  37.06 
 
 
371 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.48 
 
 
364 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 
365 aa  149  9e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  32.45 
 
 
365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  35.02 
 
 
528 aa  146  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  35.49 
 
 
380 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  33.23 
 
 
343 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  38.3 
 
 
383 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  32.56 
 
 
376 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.01 
 
 
364 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.01 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  30.3 
 
 
365 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  31.36 
 
 
338 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  31.82 
 
 
376 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  36.03 
 
 
410 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6452  inner-membrane translocator  35.96 
 
 
357 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  33.43 
 
 
363 aa  138  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  33.83 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  30.08 
 
 
442 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  32.05 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  28.53 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  30.93 
 
 
358 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  34.23 
 
 
347 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  33.03 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  31.04 
 
 
400 aa  131  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  32.94 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  40.19 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  28.27 
 
 
362 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  33.04 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  31.79 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  33.05 
 
 
365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  32.63 
 
 
358 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  28.78 
 
 
364 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4401  inner-membrane translocator  36.42 
 
 
400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  36.64 
 
 
379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  27.27 
 
 
403 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  30.57 
 
 
368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  31.53 
 
 
377 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 
352 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  32.73 
 
 
348 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  30.79 
 
 
368 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 
352 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  31.7 
 
 
379 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.04 
 
 
373 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.64 
 
 
471 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  32.29 
 
 
369 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  34.3 
 
 
475 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  31.65 
 
 
463 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  29.64 
 
 
350 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  37.23 
 
 
451 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  31.53 
 
 
356 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1314  inner-membrane translocator  36.25 
 
 
375 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.725707  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  31.74 
 
 
365 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  38.89 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.18 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  34.93 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0906  inner-membrane translocator  32.52 
 
 
344 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222842  normal  0.224107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  36.81 
 
 
426 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  32.15 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  32.15 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  32.15 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.88 
 
 
355 aa  119  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  31.86 
 
 
352 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  31.86 
 
 
352 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.93 
 
 
347 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  28.36 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  30.59 
 
 
352 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>