More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1654 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  69.17 
 
 		 550 aa  674    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  68.33 
 
 		 549 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  69.17 
 
 		 538 aa  673    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  65.76 
 
 		 524 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  65.76 
 
 		 524 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  68.96 
 
 		 532 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  65.76 
 
 		 530 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  65.76 
 
 		 530 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  66.67 
 
 		 515 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  65.76 
 
 		 524 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  65.76 
 
 		 524 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  65.76 
 
 		 524 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 477 aa  961    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  66.39 
 
 		 521 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  68.96 
 
 		 535 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  90.99 
 
 		 477 aa  855    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  65.49 
 
 		 530 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  66.88 
 
 		 515 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  66.88 
 
 		 515 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  67.08 
 
 		 515 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  66.25 
 
 		 513 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  66.88 
 
 		 515 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  66.6 
 
 		 511 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  63.86 
 
 		 522 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  63.86 
 
 		 526 aa  614  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  55.93 
 
 		 479 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  55.72 
 
 		 479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  54.89 
 
 		 478 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  54.33 
 
 		 480 aa  500  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  53.56 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  53.19 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  53.44 
 
 		 478 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  53.44 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  52.62 
 
 		 481 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  47.66 
 
 		 490 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  50.54 
 
 		 482 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  47.3 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  47.46 
 
 		 480 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  52.87 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  48.3 
 
 		 476 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  48.07 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  46.97 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  47.82 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  46.19 
 
 		 441 aa  361  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  52.87 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  46.73 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  47.36 
 
 		 438 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  47.36 
 
 		 438 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  45.58 
 
 		 438 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  47.13 
 
 		 438 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  51.32 
 
 		 436 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  46.36 
 
 		 445 aa  349  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  46.44 
 
 		 437 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  49.73 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  47.93 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  45.68 
 
 		 439 aa  346  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  50.4 
 
 		 439 aa  346  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  44.99 
 
 		 446 aa  342  8e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  46.14 
 
 		 445 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  43.36 
 
 		 462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  44.69 
 
 		 451 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  42.23 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  46.35 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  46.58 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  46.13 
 
 		 451 aa  323  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  46.11 
 
 		 445 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  46.11 
 
 		 445 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  46.51 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  43.41 
 
 		 456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  44.87 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  46.51 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  44.36 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  40.97 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  44.44 
 
 		 443 aa  318  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  42.69 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  43.58 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  45.57 
 
 		 440 aa  316  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  45.31 
 
 		 445 aa  315  8e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  45.05 
 
 		 445 aa  315  9e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  44.28 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  40.97 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  42.11 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  47.98 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  44.62 
 
 		 452 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  44.95 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  39.61 
 
 		 444 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  47.51 
 
 		 445 aa  312  9e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  42.78 
 
 		 444 aa  312  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  43.04 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  42.52 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  45.03 
 
 		 440 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  45.03 
 
 		 440 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  46.45 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  44.09 
 
 		 440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  44.5 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  46.15 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  42.73 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  44.5 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  43.89 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>