More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4746 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  100 
 
 		 340 aa  680    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  77.71 
 
 		 368 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  78.99 
 
 		 340 aa  524  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  80.57 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4820  inner-membrane translocator  70.22 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  52.9 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  49.69 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  52.57 
 
 		 322 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  55.35 
 
 		 321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  46.59 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  49.38 
 
 		 337 aa  275  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  47.76 
 
 		 594 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  50.33 
 
 		 361 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  48.52 
 
 		 597 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 343 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 346 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 324 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  52.75 
 
 		 354 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  49.01 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  40.98 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.75 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  43.14 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  35.18 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 329 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 328 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 327 aa  152  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  36.81 
 
 		 838 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.79 
 
 		 632 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  39.42 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 652 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  33.33 
 
 		 621 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4109  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.84 
 
 		 298 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.6 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 642 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  34.73 
 
 		 628 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.31 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  39.92 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1402  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.744825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0838  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.825897  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 637 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.17 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  40 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3726  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2463  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1210  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3117  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.848648 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 646 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 339 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 339 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.56 
 
 		 646 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5446  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  34.87 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1946  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 411 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 349 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.3 
 
 		 424 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2247  transmembrane ABC transporter protein  34.39 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0431032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  33.56 
 
 		 852 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2452  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>