More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3907 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
340 aa  699    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  37.91 
 
 
313 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  38.78 
 
 
321 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  40.67 
 
 
331 aa  176  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  42.05 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  36.27 
 
 
348 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  38.1 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  39.83 
 
 
324 aa  166  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  36.78 
 
 
323 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  37.65 
 
 
326 aa  162  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  39.94 
 
 
332 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  35.42 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  41.19 
 
 
337 aa  156  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  39.44 
 
 
328 aa  155  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  41.95 
 
 
336 aa  152  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  34.73 
 
 
349 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  36.21 
 
 
324 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  35.77 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  37.43 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  38.94 
 
 
292 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  38.18 
 
 
308 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  34.23 
 
 
338 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  35.39 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  38.87 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  34.82 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  37.41 
 
 
386 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  37.53 
 
 
350 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  36.03 
 
 
319 aa  136  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  37.75 
 
 
318 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  36.66 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  36.41 
 
 
366 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  30.96 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  37.57 
 
 
312 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  32.71 
 
 
353 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  37.37 
 
 
366 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  37.14 
 
 
352 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  34.76 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  35.71 
 
 
359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  36.89 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  35.7 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  35.73 
 
 
333 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  33.06 
 
 
330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  38.75 
 
 
380 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  37.27 
 
 
331 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  34.64 
 
 
369 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  34.52 
 
 
336 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  34.68 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  34.7 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  36.86 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  33.25 
 
 
363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  35.84 
 
 
351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  34.74 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  33.7 
 
 
333 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  36.48 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  29.97 
 
 
338 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  52.13 
 
 
245 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  38.17 
 
 
362 aa  99.4  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  43.04 
 
 
367 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  40.76 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  28.19 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  32.01 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  50.68 
 
 
356 aa  92.8  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  38.65 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  27.02 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  46.05 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  50.65 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  82.46 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  32.87 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  24.43 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  28.57 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  23.82 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  70 
 
 
431 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  49.21 
 
 
352 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  38.24 
 
 
173 aa  57  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  40.3 
 
 
219 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  49.23 
 
 
142 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  39.13 
 
 
129 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  47.69 
 
 
142 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  36.21 
 
 
138 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  40 
 
 
252 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  45 
 
 
196 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  44.26 
 
 
171 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  45.61 
 
 
152 aa  51.2  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  35.53 
 
 
168 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  40.62 
 
 
128 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.76 
 
 
151 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  40.62 
 
 
124 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  40.91 
 
 
140 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0563  hypothetical protein  42.47 
 
 
227 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.731892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  36.71 
 
 
124 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  39.06 
 
 
124 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.91 
 
 
155 aa  50.4  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.46 
 
 
156 aa  50.4  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3737  type II secretion pathway protein XcpT  37.29 
 
 
212 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.55 
 
 
167 aa  50.4  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 
168 aa  49.7  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  42.11 
 
 
169 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  39.06 
 
 
124 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.08 
 
 
151 aa  49.7  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.79 
 
 
163 aa  49.7  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>