More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0793 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  100 
 
 		 406 aa  818    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  33.51 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  33.23 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  33.23 
 
 		 373 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  30.34 
 
 		 404 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  27.51 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.9 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  29.34 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  33.74 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  29.28 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  27.98 
 
 		 412 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  26.97 
 
 		 392 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  26.47 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  27.44 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.3 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  29.58 
 
 		 413 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  28.31 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  27.49 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.81 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  29.64 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  26.65 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.79 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  25.47 
 
 		 419 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.49 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  29.18 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.63 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.65 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  28.65 
 
 		 481 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  30.03 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.87 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.03 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  28.07 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  29.45 
 
 		 421 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.86 
 
 		 423 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.92 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  26.18 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  27.2 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  27.89 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  25.34 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 414 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  26.37 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 587 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.2 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  28.66 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  27.94 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.72 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  29.41 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.95 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.2 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  25.47 
 
 		 390 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  26.18 
 
 		 425 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  29.41 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  25 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  25.28 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  25.08 
 
 		 580 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.77 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  25.54 
 
 		 435 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  26.97 
 
 		 428 aa  99.8  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  26.16 
 
 		 422 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  26 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  25.07 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  22.97 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  22.97 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  24.93 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  24.44 
 
 		 423 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  25.65 
 
 		 402 aa  96.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  23.49 
 
 		 400 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  27.76 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  25.28 
 
 		 537 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  25.47 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  27.6 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  22.48 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  26.24 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  25.29 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.56 
 
 		 407 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  26.12 
 
 		 528 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  27.11 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  27.13 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  28.05 
 
 		 437 aa  87.4  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  28.16 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  22.74 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  28.16 
 
 		 271 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  26.97 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  26.85 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  25.59 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  24.92 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  26.51 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  28.99 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  24.92 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  25.4 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  23.53 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  23.68 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  23.53 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  22.94 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>