More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0407 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  100 
 
 		 419 aa  845    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  43.76 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  41.71 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  43.5 
 
 		 417 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  43.5 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  43.22 
 
 		 417 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  38.9 
 
 		 404 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  38.89 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  39.37 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  39.23 
 
 		 405 aa  298  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  39.61 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  39.9 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  37.12 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  38.85 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  37.68 
 
 		 419 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  36.78 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  38.13 
 
 		 403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  36.9 
 
 		 406 aa  285  8e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  38.65 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  37.27 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  35.32 
 
 		 402 aa  279  8e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  35.95 
 
 		 408 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  38.22 
 
 		 405 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  36.08 
 
 		 407 aa  276  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  37.38 
 
 		 412 aa  275  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  35.02 
 
 		 403 aa  275  9e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  38.66 
 
 		 401 aa  275  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  35.24 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  35.65 
 
 		 403 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  35.99 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  36.04 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  35.51 
 
 		 401 aa  270  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  36.41 
 
 		 409 aa  269  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  36.45 
 
 		 409 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  36.04 
 
 		 407 aa  269  8.999999999999999e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  34.71 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  35.19 
 
 		 424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  34.21 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  34.54 
 
 		 408 aa  266  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  35.58 
 
 		 421 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  35.39 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  33.98 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  35.19 
 
 		 408 aa  263  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  35.95 
 
 		 417 aa  262  8e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  34.04 
 
 		 404 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  34.04 
 
 		 404 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  36.45 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  34.94 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  36.45 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  35.35 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  36.06 
 
 		 409 aa  262  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  34.94 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  40 
 
 		 403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  32.37 
 
 		 409 aa  259  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  35.24 
 
 		 417 aa  259  9e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  34.22 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  33.81 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  34.22 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  33.41 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31.88 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  35.92 
 
 		 408 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.89 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  34.87 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  33.97 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.77 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  33.41 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  33.74 
 
 		 419 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  34.38 
 
 		 405 aa  254  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  32.52 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  30.36 
 
 		 406 aa  252  7e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  34.71 
 
 		 405 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  32.94 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  34.36 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.41 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  37.41 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  37.41 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.4 
 
 		 423 aa  249  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  32.78 
 
 		 463 aa  249  6e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  32.37 
 
 		 419 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  35.95 
 
 		 409 aa  249  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.04 
 
 		 419 aa  249  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  32.78 
 
 		 463 aa  249  7e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  34.47 
 
 		 405 aa  249  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  31.73 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  32.93 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  36.84 
 
 		 410 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  35 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  31.48 
 
 		 423 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  37.09 
 
 		 411 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  36.79 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  32.32 
 
 		 405 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  33.41 
 
 		 405 aa  243  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.93 
 
 		 405 aa  242  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  35.63 
 
 		 409 aa  242  9e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  33.9 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  37.2 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  32.7 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  34.52 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>