More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0256 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  100 
 
 		 308 aa  625  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  47.3 
 
 		 319 aa  305  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  46.1 
 
 		 308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  44.62 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  44.62 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  44.37 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  45.82 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  45.77 
 
 		 316 aa  271  8.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  43.89 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  43.56 
 
 		 311 aa  251  9.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  43.53 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  42.36 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  39.02 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3515  ABC transporter related  41.12 
 
 		 313 aa  232  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  39.22 
 
 		 316 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  38.89 
 
 		 316 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  39.22 
 
 		 316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  36.39 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  39.03 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  39.22 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.08 
 
 		 311 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  35.31 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  34.19 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  36.39 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  34.62 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  35.69 
 
 		 306 aa  192  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  35.88 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  34.95 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  36.57 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  38.11 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  34.29 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  34.29 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  34.42 
 
 		 307 aa  188  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  33.55 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  39.23 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  41.33 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  34.87 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  35.18 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  44.29 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  35.5 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  42.04 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  30.92 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  32.89 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  35.58 
 
 		 327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  37.4 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.7 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  32.04 
 
 		 328 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  35.83 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  34.98 
 
 		 313 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  35.08 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  33.55 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  29.93 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  30.26 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  29.93 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  34.55 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.22 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  37.89 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  37.95 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 		 245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.84 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  34.74 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  34.1 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  40.74 
 
 		 512 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  32.57 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  40.43 
 
 		 235 aa  179  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  33.54 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  34.63 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  31.29 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  32.48 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  33.66 
 
 		 315 aa  178  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  32.21 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  33.44 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0276  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  44 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  35.48 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  42.99 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  34.43 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  32.79 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  36.71 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  33.33 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  33.88 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  33.11 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  35.55 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  39.45 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40.54 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>