198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2035 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 586 aa  1172    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 588 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 300 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 297 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  28.62 
 
 		 297 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  27.05 
 
 		 291 aa  94.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 291 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 302 aa  93.6  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 304 aa  89.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 289 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 278 aa  88.2  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 289 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 305 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 309 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 309 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 279 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  25.17 
 
 		 304 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  53.66 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  33.03 
 
 		 568 aa  73.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  30.59 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 		 299 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  22.97 
 
 		 295 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 294 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  33.51 
 
 		 578 aa  67.4  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  27.24 
 
 		 297 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 306 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  37.01 
 
 		 188 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  34.34 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  32.89 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  26.35 
 
 		 308 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  29.95 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  37.5 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  52.73 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 191 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  29.9 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 360 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  26.07 
 
 		 314 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 329 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 298 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  33 
 
 		 350 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 362 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 362 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 362 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 191 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  40.48 
 
 		 288 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 339 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 229 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 381 aa  55.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 395 aa  54.7  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  37.76 
 
 		 377 aa  54.7  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  46.38 
 
 		 380 aa  53.9  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 368 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 379 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 394 aa  53.5  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 370 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 378 aa  53.5  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2097  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 187 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 411 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 402 aa  52.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 275 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 191 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0669  epoxide hydrolase, putative  28.14 
 
 		 320 aa  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 272 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 379 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  40.58 
 
 		 386 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  35.51 
 
 		 273 aa  51.2  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 394 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 		 263 aa  50.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>