292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0150 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  58.84 
 
 		 760 aa  675    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  55.12 
 
 		 804 aa  919    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  58.84 
 
 		 760 aa  676    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  53.32 
 
 		 783 aa  859    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  52.03 
 
 		 797 aa  846    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  52.15 
 
 		 776 aa  835    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  54.52 
 
 		 802 aa  880    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  54.1 
 
 		 811 aa  878    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 860 aa  1799    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  39.88 
 
 		 771 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  42.66 
 
 		 770 aa  444  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  33.52 
 
 		 796 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  33.64 
 
 		 790 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  34.32 
 
 		 791 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  33.71 
 
 		 824 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  33.37 
 
 		 817 aa  385  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  33.14 
 
 		 827 aa  382  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  31.88 
 
 		 788 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  31.15 
 
 		 790 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  31.63 
 
 		 796 aa  363  9e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  32.14 
 
 		 787 aa  360  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  31.33 
 
 		 793 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  32.03 
 
 		 793 aa  357  6.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  31.63 
 
 		 791 aa  356  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  32.59 
 
 		 810 aa  354  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  32.7 
 
 		 825 aa  353  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  32.51 
 
 		 829 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  31.58 
 
 		 770 aa  352  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  32 
 
 		 815 aa  352  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  32.57 
 
 		 815 aa  348  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  32.3 
 
 		 821 aa  344  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  32.38 
 
 		 809 aa  342  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  31.85 
 
 		 776 aa  342  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  29.25 
 
 		 899 aa  342  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  32.05 
 
 		 800 aa  341  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  30.53 
 
 		 875 aa  340  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  30.59 
 
 		 811 aa  340  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  30.98 
 
 		 761 aa  340  5.9999999999999996e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  31.74 
 
 		 824 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  37.06 
 
 		 780 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  32.24 
 
 		 780 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  29.7 
 
 		 899 aa  334  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  30.2 
 
 		 813 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  37.38 
 
 		 765 aa  327  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  37.27 
 
 		 784 aa  328  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  37.27 
 
 		 784 aa  328  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  37.73 
 
 		 783 aa  327  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  34.85 
 
 		 583 aa  314  4.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1018  type III restriction enzyme, res subunit  32.68 
 
 		 769 aa  284  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  32.69 
 
 		 787 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2088  EcoEI R domain protein  27.76 
 
 		 546 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.25 
 
 		 1137 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1025  type III restriction enzyme, res subunit  26.82 
 
 		 753 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4243  type III restriction protein res subunit  27.11 
 
 		 933 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.71 
 
 		 1169 aa  146  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.61 
 
 		 1082 aa  146  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  25.7 
 
 		 1169 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.15 
 
 		 1124 aa  145  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  26.04 
 
 		 1170 aa  144  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  26.01 
 
 		 1005 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2747  type I restriction-modification system, R subunit  28.18 
 
 		 934 aa  140  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.504328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  27.15 
 
 		 1119 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  27.57 
 
 		 936 aa  138  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  27.3 
 
 		 936 aa  135  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2790  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.69 
 
 		 140 aa  134  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.47 
 
 		 1126 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  25.92 
 
 		 945 aa  132  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  26.54 
 
 		 1137 aa  132  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  27.42 
 
 		 932 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  25.99 
 
 		 1167 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  27.26 
 
 		 1137 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  25.97 
 
 		 1113 aa  129  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  27.15 
 
 		 932 aa  128  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  26.51 
 
 		 893 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 		 907 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  25.63 
 
 		 1138 aa  126  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0853  type III restriction enzyme, res subunit  26.16 
 
 		 921 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.0361479 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  24.84 
 
 		 912 aa  126  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  25.46 
 
 		 967 aa  125  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.43 
 
 		 1068 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  27.34 
 
 		 1115 aa  122  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.41 
 
 		 1080 aa  122  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3004  type III restriction protein res subunit  27.26 
 
 		 1129 aa  122  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385036  normal  0.0400425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  26.19 
 
 		 1133 aa  121  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  26.43 
 
 		 1141 aa  121  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  26.34 
 
 		 1125 aa  119  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  24.7 
 
 		 889 aa  119  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  24.82 
 
 		 815 aa  119  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  25.63 
 
 		 1138 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  26.28 
 
 		 1077 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1131 aa  118  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  27.14 
 
 		 1126 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  25.66 
 
 		 1068 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.15 
 
 		 1188 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  26.22 
 
 		 1233 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.24 
 
 		 1174 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1495  type III restriction enzyme, res subunit  25.58 
 
 		 931 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  26.24 
 
 		 1062 aa  115  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02066  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  25.29 
 
 		 1157 aa  114  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  26.14 
 
 		 1108 aa  114  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>