More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3779 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
526 aa  1071    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  39.3 
 
 
535 aa  365  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  38.6 
 
 
525 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  36.59 
 
 
528 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  35.29 
 
 
535 aa  319  9e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 
575 aa  313  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  35.12 
 
 
567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  37.02 
 
 
544 aa  303  5.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  36.38 
 
 
507 aa  296  8e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  34.52 
 
 
544 aa  295  2e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  41.07 
 
 
551 aa  293  4e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  37.24 
 
 
552 aa  290  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  40.4 
 
 
556 aa  290  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  42.82 
 
 
555 aa  289  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  35.33 
 
 
556 aa  286  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  42.9 
 
 
560 aa  287  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  41.22 
 
 
551 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  37.94 
 
 
549 aa  281  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  36.82 
 
 
535 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  38.72 
 
 
547 aa  276  7e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  41.84 
 
 
450 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.82 
 
 
443 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  38.29 
 
 
443 aa  230  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  41.77 
 
 
457 aa  230  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 
444 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  40.38 
 
 
444 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  38.32 
 
 
432 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  38.02 
 
 
444 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  34.65 
 
 
452 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 
439 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  38.73 
 
 
429 aa  217  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  39.49 
 
 
455 aa  216  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  39.12 
 
 
426 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  36.8 
 
 
439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
444 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  30.06 
 
 
538 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  37.73 
 
 
468 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  40.19 
 
 
441 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  39.62 
 
 
423 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  32.29 
 
 
555 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.13 
 
 
428 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  34.85 
 
 
476 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 
458 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  31.54 
 
 
550 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  34.22 
 
 
481 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  39.56 
 
 
456 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  36.72 
 
 
446 aa  204  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  38.12 
 
 
415 aa  203  8e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  37.3 
 
 
441 aa  202  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  38.34 
 
 
439 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  36.19 
 
 
434 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  36.45 
 
 
456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  40.58 
 
 
507 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  36.45 
 
 
456 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  32.53 
 
 
540 aa  200  7e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  30.82 
 
 
550 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
482 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  40 
 
 
482 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  31.96 
 
 
410 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 
422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  33.56 
 
 
563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  36.65 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  32.97 
 
 
418 aa  199  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  35.07 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  35.07 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  37.7 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 
438 aa  198  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  35.89 
 
 
483 aa  197  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  34.98 
 
 
468 aa  196  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  37.8 
 
 
524 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  37.8 
 
 
530 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  35.15 
 
 
564 aa  195  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  37.8 
 
 
524 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  37.8 
 
 
524 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  37.8 
 
 
524 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  38.11 
 
 
515 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 
524 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 
530 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  37.5 
 
 
521 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 
565 aa  195  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  37.2 
 
 
526 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 
515 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 
515 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  37.2 
 
 
522 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  34.39 
 
 
428 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 
515 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  35.35 
 
 
433 aa  194  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  38.49 
 
 
461 aa  193  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  35.24 
 
 
535 aa  193  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  37.2 
 
 
530 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  37.2 
 
 
538 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  35.95 
 
 
478 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  37.2 
 
 
550 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  38.85 
 
 
398 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  35.09 
 
 
477 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  37.2 
 
 
515 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  36.81 
 
 
462 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 
444 aa  191  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  36.28 
 
 
549 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  35.48 
 
 
429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>