More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2203 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 452 aa  950    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  65.26 
 
 		 451 aa  618  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  61.3 
 
 		 458 aa  597  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  60.31 
 
 		 446 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  59.64 
 
 		 441 aa  565  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 485 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  25.64 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 460 aa  136  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 448 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 478 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  25.05 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  24.47 
 
 		 451 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.11 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  23.18 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 403 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  24.67 
 
 		 437 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  25.24 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 436 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  24.05 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  24.74 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  24.61 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.93 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  22.4 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 451 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  23.35 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  23.73 
 
 		 451 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  23.77 
 
 		 518 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 476 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  24.46 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  22.58 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  21.27 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  22.2 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  24.21 
 
 		 490 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  22.61 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1134  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  24.66 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  23.62 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  24.21 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  23.57 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  19.74 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 		 358 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  22.19 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  26.7 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.95 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  21.09 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  21.28 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  25.6 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  37.36 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 335 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  22.86 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  28.66 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  24.19 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  30 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  19.76 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 347 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.86 
 
 		 343 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.86 
 
 		 343 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  23.21 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>