242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3556 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 172 aa  346  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  63.1 
 
 		 172 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  61.9 
 
 		 172 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  61.31 
 
 		 172 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.93 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.95 
 
 		 172 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 		 177 aa  154  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.13 
 
 		 182 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  44.32 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.13 
 
 		 182 aa  147  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  44.57 
 
 		 177 aa  140  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  40.91 
 
 		 180 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.05 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.45 
 
 		 181 aa  137  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.29 
 
 		 188 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.64 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  38.64 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  43.43 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  36.93 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  37.85 
 
 		 183 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.64 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  38.42 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.26 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  36.16 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.29 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.29 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.36 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  36.97 
 
 		 227 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.9 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  37.57 
 
 		 186 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  38.95 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.8 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  37.79 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  36.99 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.99 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.8 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.43 
 
 		 184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.86 
 
 		 181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  37.21 
 
 		 219 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  33.91 
 
 		 225 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  35.26 
 
 		 213 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.26 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.99 
 
 		 188 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  35.9 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  37.29 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  36.99 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  36.42 
 
 		 207 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  38.6 
 
 		 409 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.52 
 
 		 181 aa  103  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.93 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  35.75 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  29.71 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  32.54 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.11 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.32 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.32 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  38.15 
 
 		 198 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 		 197 aa  97.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.84 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  34.84 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  34.84 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  31.25 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.42 
 
 		 182 aa  94.4  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  29.94 
 
 		 182 aa  94  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  35.2 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  29.34 
 
 		 188 aa  91.7  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  30.86 
 
 		 191 aa  90.9  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  30.59 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  30.97 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  31.43 
 
 		 192 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  29.65 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  30.91 
 
 		 183 aa  87.4  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  30.3 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  27.71 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  32.57 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  29.65 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.01 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  29.7 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  29.17 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  26.22 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.41 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.61 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.55 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  28.92 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.05 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  30.11 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.05 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  30 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  27.52 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  30.41 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.41 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.59 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.24 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.41 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.06 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.06 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.38 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.47 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.99 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.06 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>