More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0179 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  57.51 
 
 		 233 aa  274  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  54.08 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  56.41 
 
 		 239 aa  259  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  54.94 
 
 		 236 aa  258  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  54.51 
 
 		 236 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  55.13 
 
 		 237 aa  258  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  55.79 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  54.94 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  54.51 
 
 		 232 aa  254  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  54.43 
 
 		 237 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  53.65 
 
 		 232 aa  248  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  53.22 
 
 		 237 aa  245  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  52.32 
 
 		 243 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  52.32 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  53.65 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  57.14 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  53.24 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  56.05 
 
 		 230 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  54.88 
 
 		 229 aa  234  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  50.42 
 
 		 242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  51.11 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  48.93 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  52.31 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45.61 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  45.18 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  47.21 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  48.73 
 
 		 240 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  48.07 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  47.86 
 
 		 244 aa  207  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  47.21 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  47.86 
 
 		 246 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  46.49 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  46.22 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  47.86 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  45.5 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  48.07 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  48.07 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  46.12 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  47.64 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  44.83 
 
 		 235 aa  201  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  46.78 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  45.69 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  48.07 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.4 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.73 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  46.78 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  45.06 
 
 		 237 aa  197  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  44.21 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.06 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  45.06 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  41.63 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.64 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  43.97 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  45.45 
 
 		 822 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  45.49 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  42.42 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  44.64 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.87 
 
 		 484 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  45.06 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.3 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.3 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  45.29 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  43.72 
 
 		 823 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  44.84 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  45.26 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  42.06 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  44.21 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  44.54 
 
 		 252 aa  191  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  43.72 
 
 		 823 aa  191  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  41.99 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  42.06 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  43.83 
 
 		 827 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2717  ABC transporter related  45.33 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  41.99 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  44.21 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  44.21 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  41.2 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.78 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.06 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.06 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  42.92 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  45.06 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  40.34 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  42.37 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  40.68 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.52 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  42.92 
 
 		 241 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1931  ABC transporter related  44.91 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>