More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1716 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  100 
 
 		 440 aa  896    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  39.58 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  41.33 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  38.55 
 
 		 426 aa  292  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  39.52 
 
 		 423 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  39.04 
 
 		 423 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  40.1 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  36.75 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  35.65 
 
 		 443 aa  243  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  34.72 
 
 		 501 aa  212  9e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  31.48 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  31.88 
 
 		 443 aa  200  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  34 
 
 		 466 aa  199  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  31.33 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  28.29 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  28.68 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  28.81 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  28.18 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  28.32 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  28.07 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 457 aa  133  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  26.9 
 
 		 416 aa  133  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  27.48 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  24.63 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  23.82 
 
 		 496 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  26.67 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  26.27 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  27.14 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 447 aa  99.8  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  28.16 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  30.79 
 
 		 430 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 436 aa  94  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  25.94 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  27.75 
 
 		 473 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  27.82 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 449 aa  91.7  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4395  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0762591  normal  0.909511 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  25.87 
 
 		 444 aa  90.9  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4285  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 456 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  28.24 
 
 		 437 aa  89.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  27.5 
 
 		 446 aa  87  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  26.46 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.94 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.54 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1047  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3567  outer membrane efflux protein  26.02 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  22.22 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.09 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.48 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4051  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 455 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.48 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  24.39 
 
 		 487 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1617  Outer membrane protein-like protein  25.27 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  23.41 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  22.35 
 
 		 1480 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  26.68 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  24.79 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  20.79 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.1 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  25.07 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  25.96 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1302  outer membrane efflux protein  23.85 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.76 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0648  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  25.52 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.07 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  25.93 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6771  heavy metal efflux pump, CzcA family  24.34 
 
 		 1469 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>