118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2022 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  100 
 
 		 340 aa  698    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  84.66 
 
 		 323 aa  557  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  84.66 
 
 		 330 aa  559  1e-158  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  83.78 
 
 		 323 aa  555  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  52.34 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.22 
 
 		 356 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.75 
 
 		 388 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.94 
 
 		 360 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  29.69 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  26.59 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  28.45 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  28.57 
 
 		 370 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  27.96 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.15 
 
 		 370 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.69 
 
 		 368 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  24.59 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  30.2 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  26.87 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  23.77 
 
 		 380 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  28.1 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  30.96 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  28.53 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  27.27 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  29.49 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  28.87 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  31.75 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  31.75 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  27.69 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  31.75 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  30.62 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  31.84 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  30.62 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  31.25 
 
 		 363 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.14 
 
 		 369 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  31.75 
 
 		 356 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  31.75 
 
 		 353 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  31.37 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  29.9 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  29.57 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  27.19 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  29.85 
 
 		 344 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  27.57 
 
 		 342 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.05 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  28.7 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  28.7 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  28.71 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2765  band 7 protein  25.12 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  27.7 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  27.53 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.14 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0822  band 7 protein  23.22 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  22.7 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  30.92 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  27.31 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  29.06 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  20.74 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  53.19 
 
 		 1151 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  50 
 
 		 1149 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  53.19 
 
 		 1148 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  51.06 
 
 		 1151 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  28.66 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  48.94 
 
 		 1139 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  50.77 
 
 		 288 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  51.06 
 
 		 1141 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  48.94 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  48.94 
 
 		 1291 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.91 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  48.08 
 
 		 100 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  48.08 
 
 		 100 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.298967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  43.4 
 
 		 1123 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4022  protein serine/threonine phosphatase  44.68 
 
 		 642 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  48.84 
 
 		 1138 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0448  zinc finger, RanBP2-type  46 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  52.08 
 
 		 131 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  40.43 
 
 		 1105 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0586  hypothetical protein  46.94 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0026  putative protein serine/threonine phosphatase  42.55 
 
 		 651 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0509  hypothetical protein  43.64 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000846135  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  38.3 
 
 		 1093 aa  49.3  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  38.46 
 
 		 505 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  44.68 
 
 		 110 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1141  hypothetical protein  22.03 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0619  putative protein serine/threonine phosphatase  42.55 
 
 		 733 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163625  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2434  FHA domain-containing protein  37.14 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0872027  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  44 
 
 		 1503 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3047  FHA domain-containing protein  37.68 
 
 		 275 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  48.94 
 
 		 101 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2329  putative protein serine/threonine phosphatase  40.43 
 
 		 669 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.580462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2278  putative protein serine/threonine phosphatase  40.43 
 
 		 669 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  35.38 
 
 		 514 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  37.93 
 
 		 383 aa  46.2  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3305  hypothetical protein  36.62 
 
 		 123 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1477  hypothetical protein  36.67 
 
 		 155 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  44.9 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4216  FHA domain-containing protein  45.1 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000473857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2306  hypothetical protein  40.38 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0534  FHA domain-containing protein  45.1 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.895952  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1521  FHA domain-containing protein  45.1 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111872  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.18 
 
 		 1089 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0271  FHA domain containing protein  33.78 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.373949 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>