More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1802 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1802  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  360  8e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0727976 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0482  hypothetical protein  81.91 
 
 		 189 aa  277  8e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.215693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1637  hypothetical protein  85.03 
 
 		 189 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1852  hypothetical protein  81.58 
 
 		 191 aa  251  6e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.677058 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1492  hypothetical protein  49.15 
 
 		 215 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.281549  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0603  MscS Mechanosensitive ion channel  51.32 
 
 		 205 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0752  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  45.45 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0265282 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  36.28 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  39.39 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  44.58 
 
 		 278 aa  71.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  35.4 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  47.06 
 
 		 389 aa  68.2  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  35.44 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  45.59 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  44.29 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  44.78 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  42.5 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1298  MscS Mechanosensitive ion channel  39.24 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.861763  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  40.26 
 
 		 460 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  34.97 
 
 		 278 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  40.26 
 
 		 460 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  45.07 
 
 		 283 aa  64.7  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  39.44 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 275 aa  64.3  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  38.96 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  38.96 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  44.29 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  38.96 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  38.96 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  38.96 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  38.96 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  38.96 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  44.74 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  38.96 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  42.65 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 549 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 549 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  25.81 
 
 		 813 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  41.43 
 
 		 414 aa  62.8  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 549 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  42.25 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  39.74 
 
 		 261 aa  62  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  39.76 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 551 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  44.93 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  41.43 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0539  MscS mechanosensitive ion channel  37.39 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 294 aa  61.6  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  33.04 
 
 		 331 aa  61.6  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 551 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 		 296 aa  61.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 550 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  34.91 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  39.47 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  35.38 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  32.87 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  32.87 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1729  MscS Mechanosensitive ion channel  35.44 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356127  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  35.9 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  34.52 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  34.82 
 
 		 538 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  34.68 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  38.67 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  34.94 
 
 		 544 aa  59.3  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3856  MscS mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20088  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0484  MscS mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  39.51 
 
 		 599 aa  58.9  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0463  MscS mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0487  MscS Mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 533 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 547 aa  58.9  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  28.77 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 352 aa  58.5  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  39.47 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.23 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00678  mechanosensitive ion channel family protein  32.86 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.096226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0457  MscS mechanosensitive ion channel  40.23 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  34.94 
 
 		 540 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  40.79 
 
 		 269 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>