More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1556 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 464 aa  933    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  98.28 
 
 		 464 aa  922    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  58.62 
 
 		 455 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27541  tRNA modification GTPase TrmE  58.41 
 
 		 465 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  55.77 
 
 		 450 aa  535  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  54.9 
 
 		 451 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  46.57 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  47.45 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  46.94 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  46.58 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  46.07 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  46.94 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  48.71 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  48.5 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  48.15 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  48.28 
 
 		 460 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  46.1 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  44.64 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  41.42 
 
 		 463 aa  350  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  37.72 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  40.65 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 458 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  37.09 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.52 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 461 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 460 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  39.52 
 
 		 459 aa  319  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  38.23 
 
 		 455 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 461 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 		 458 aa  316  7e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 		 458 aa  315  9e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  37.37 
 
 		 456 aa  315  9e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49818  predicted protein  38.33 
 
 		 525 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  38.21 
 
 		 454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  36.5 
 
 		 458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  36.5 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.18 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 		 462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  38.56 
 
 		 460 aa  303  5.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  38.44 
 
 		 461 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  38.96 
 
 		 460 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  37.91 
 
 		 458 aa  300  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  38.36 
 
 		 458 aa  298  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  34.27 
 
 		 459 aa  296  6e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  37.89 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  35.14 
 
 		 459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  35.14 
 
 		 459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  34.48 
 
 		 461 aa  289  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  37.03 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  36.46 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  38.6 
 
 		 455 aa  286  7e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  36.77 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  35.91 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  36.97 
 
 		 459 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  36.19 
 
 		 454 aa  282  9e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  36.19 
 
 		 454 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  36.05 
 
 		 455 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  36.27 
 
 		 455 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  36.19 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 454 aa  281  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  35.53 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  38.41 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  37.8 
 
 		 459 aa  279  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  37.28 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  35.53 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 454 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  36.05 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  37.71 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 444 aa  276  4e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  35.19 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  36.93 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  39.13 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  35.48 
 
 		 458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  35.73 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 464 aa  274  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  35.99 
 
 		 467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  35.99 
 
 		 467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  35.99 
 
 		 454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  35.99 
 
 		 467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  35.99 
 
 		 454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  35.34 
 
 		 454 aa  273  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  36.11 
 
 		 460 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  37.1 
 
 		 453 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  35.99 
 
 		 441 aa  272  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>