More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0283 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 321 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  97.8 
 
 		 318 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1278  preprotein translocase subunit SecF  58.22 
 
 		 328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.630686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1192  preprotein translocase subunit SecF  59.27 
 
 		 329 aa  329  4e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16231  preprotein translocase subunit SecF  56.37 
 
 		 359 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205013 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07171  preprotein translocase subunit SecF  54.75 
 
 		 322 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434985  normal  0.295105 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  43.83 
 
 		 304 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09301  preprotein translocase subunit SecF  44.37 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.359776  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  43.73 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10111  preprotein translocase subunit SecF  43.87 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  40.84 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  38.8 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  40.13 
 
 		 310 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  41.07 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  41.94 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  39.68 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  40.13 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  38.49 
 
 		 320 aa  192  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.66 
 
 		 735 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  31.13 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  35.25 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  32.57 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  32.8 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  32.69 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  32.48 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  31.46 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  35.03 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  32.03 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  33.69 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  30.67 
 
 		 989 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  30.89 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  30.85 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  30.88 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  30.88 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  30.88 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  31.01 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  31.01 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  30.47 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  32.97 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  32.85 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  31.91 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  30.42 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  29.06 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  31.77 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  31.56 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  30.89 
 
 		 301 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  31.56 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  31.56 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  30.25 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  30.77 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  33.7 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 		 995 aa  137  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  30.66 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  31.41 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  33.09 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  34.8 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  31.89 
 
 		 291 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  29.22 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  29.11 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.72 
 
 		 762 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  31.72 
 
 		 315 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  31.11 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  31.08 
 
 		 761 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  28.77 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  30.63 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.833906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  31.09 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  31.19 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  29.3 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  31.46 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  31.46 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  30.27 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  29.93 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  30.14 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  32.21 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  29.97 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  29.93 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  29.93 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  30.47 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  33.7 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  29.75 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  30.86 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  29.58 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.87 
 
 		 977 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  31.14 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  31.75 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  29.87 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3884  preprotein translocase subunit SecF  31.21 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0703005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  30.13 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  31.72 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  34.34 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  31.72 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  30.64 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  34.19 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  31.65 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>