More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0074 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  100 
 
 
340 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  98.53 
 
 
340 aa  678    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  47.98 
 
 
348 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07421  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  51.38 
 
 
335 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.784304  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  45.34 
 
 
328 aa  269  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  44.92 
 
 
322 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  42.86 
 
 
333 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  41.56 
 
 
333 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  42.63 
 
 
333 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  41.38 
 
 
333 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  35.33 
 
 
330 aa  168  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  33.63 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  29.52 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  30.79 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  30 
 
 
320 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  30 
 
 
320 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  37.19 
 
 
298 aa  132  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  29.52 
 
 
320 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  29.48 
 
 
334 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  29.61 
 
 
321 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  30.42 
 
 
323 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  28.17 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  28.15 
 
 
334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  27.86 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  28.15 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  28.61 
 
 
316 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  28.48 
 
 
318 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 
304 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  27.95 
 
 
334 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  30.94 
 
 
302 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  30.8 
 
 
309 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  31.78 
 
 
309 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  31.25 
 
 
309 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  28.7 
 
 
337 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  30.51 
 
 
309 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  28.7 
 
 
337 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  26.51 
 
 
311 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.69 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  28.24 
 
 
338 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.79 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.54 
 
 
301 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.15 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  26.67 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56588  predicted protein  31.17 
 
 
545 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  26.79 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  29.34 
 
 
433 aa  91.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.7 
 
 
310 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  30.05 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  29.35 
 
 
308 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  26.19 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
317 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4180  predicted protein  28.52 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0280434  decreased coverage  0.000647505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.38 
 
 
306 aa  86.3  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  29.07 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.38 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.78 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.77 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.75 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 
288 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  23.42 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  26.99 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.31 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  27.15 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.43 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.29 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.99 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.84 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32314  predicted protein  31.19 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.99 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.99 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.01 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  24.22 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  23.36 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  27.03 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05270  AY086643 putativepod-specific dehydrogenase SAC25, putative  29.63 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.68 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.76 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  25.85 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.17 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.46 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.16 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10494  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 
327 aa  77  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.06 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  26.41 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  29.66 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  29.66 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  23.38 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.69 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.86 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.22 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.83 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>