More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49325 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49325  predicted protein  100 
 
 		 343 aa  710    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89338  arnesyl diphosphate synthetase (FPP synthetase)  51.2 
 
 		 350 aa  348  8e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34113  predicted protein  50.94 
 
 		 348 aa  342  5e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.176681 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04510  isoprenoid biosynthesis-related protein, putative  50.15 
 
 		 374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08012  polyprenyl synthetase (Eurofung)  49.53 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.149955  normal  0.151034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.33 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  28.71 
 
 		 362 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  30.68 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  29.41 
 
 		 331 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  30.43 
 
 		 324 aa  86.3  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  29.8 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  30 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  30 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  26.65 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  27.71 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  28.69 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  33.19 
 
 		 634 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  29.32 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  26.04 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  30.59 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  29.09 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  27.83 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.86 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  30.51 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  29.89 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.42 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  29.35 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  25.67 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  28.05 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  29.71 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  25.98 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  27.51 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  25.18 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  28.39 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  27.08 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  27.48 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  27.48 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  29.12 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.17 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  29.55 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  28.93 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  26.39 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  30.24 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  28.99 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  29.2 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  29.2 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  25 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  27.57 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  30.9 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  29.12 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  27.16 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  29.41 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25.16 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0508  polyprenyl synthetase  27.43 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000945867  normal  0.644632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0550  polyprenyl synthetase  27.43 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400591  normal  0.0346751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0098  trans-hexaprenyltranstransferase  27.43 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478178  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  27.27 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0483  trans-hexaprenyltranstransferase  27.43 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000223454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0580  trans-hexaprenyltranstransferase  27.43 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  28.9 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2803  polyprenyl synthetase  27.43 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000673013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  25.95 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3665  trans-hexaprenyltranstransferase  27.43 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000484392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  28.63 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  28.63 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  27.47 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  24.71 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  28.63 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  25.21 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  26.38 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  28.87 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1139  octaprenyl-diphosphate synthase  26.41 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  26.78 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3491  octaprenyl-diphosphate synthase  26.41 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524  octaprenyl-diphosphate synthase  26.41 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0921642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0447  octaprenyl-diphosphate synthase  26.41 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  27.85 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3257  octaprenyl-diphosphate synthase  26.41 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.94 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1306  octaprenyl-diphosphate synthase  26.41 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  24.44 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  28.9 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  27.94 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  28.9 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  23.02 
 
 		 313 aa  67  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3527  octaprenyl-diphosphate synthase  26.55 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3524  octaprenyl-diphosphate synthase  26.55 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  25.71 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  26.13 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  24.8 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  27.93 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  28.5 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  28.02 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  24.79 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  26.92 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  26.27 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.44 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  26.01 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  28.51 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  28.86 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>