205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43052 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43052  predicted protein  100 
 
 
704 aa  1446    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43552  predicted protein  38.23 
 
 
971 aa  389  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774573  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78097  monovalent cation:H+ antiporter, CPA1 family (NHX1)  28.23 
 
 
653 aa  144  7e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.147084  normal  0.966822 
 
 
-
 
NC_006686  CND04380  monovalent inorganic cation transporter, putative  27.33 
 
 
698 aa  143  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22353  predicted protein  26.96 
 
 
464 aa  135  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02288  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  26.1 
 
 
703 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1764  predicted protein  25 
 
 
389 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289242  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1871  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  28.69 
 
 
427 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  33.18 
 
 
521 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2316  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  25.75 
 
 
357 aa  92  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967211  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  36.49 
 
 
705 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  32.42 
 
 
427 aa  88.6  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14403  phospholipase  23.33 
 
 
359 aa  87  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990038  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  27.47 
 
 
527 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  32.57 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  32.68 
 
 
399 aa  83.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  28.35 
 
 
682 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  30.84 
 
 
520 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.64 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  34.74 
 
 
427 aa  81.3  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 
725 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  31.91 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  37.66 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  29.07 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  32.47 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 
680 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  31.05 
 
 
788 aa  76.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  23.86 
 
 
534 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  28.89 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  28.26 
 
 
832 aa  74.3  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  31 
 
 
812 aa  73.9  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 
424 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.18 
 
 
435 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  37.59 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  31.28 
 
 
424 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 
411 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  31.28 
 
 
424 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  35.9 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  31.74 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.13 
 
 
434 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  27.19 
 
 
526 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2906  Sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 
431 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  27.19 
 
 
526 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  31.1 
 
 
421 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  38.76 
 
 
427 aa  70.5  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  27.19 
 
 
526 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  27.19 
 
 
526 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  27.19 
 
 
526 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  27.19 
 
 
526 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 
434 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.63 
 
 
389 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  26.73 
 
 
526 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4985  sodium/hydrogen exchanger  37.39 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0820317  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  27.78 
 
 
1247 aa  68.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  28.64 
 
 
528 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  30.14 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  38.76 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  39.84 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  27.19 
 
 
874 aa  66.6  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  29.67 
 
 
419 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  29.68 
 
 
835 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 
434 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  26.15 
 
 
551 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  27.15 
 
 
524 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 
434 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  27.73 
 
 
533 aa  65.1  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  31.88 
 
 
417 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  27.73 
 
 
533 aa  65.1  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 
434 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 
434 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 
434 aa  64.3  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  27.19 
 
 
526 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  38.02 
 
 
420 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  28.51 
 
 
654 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  33.53 
 
 
410 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  26.96 
 
 
832 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  26.96 
 
 
832 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  25.57 
 
 
535 aa  62  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  37.61 
 
 
422 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  28.57 
 
 
425 aa  60.8  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  28.43 
 
 
539 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  28.3 
 
 
436 aa  60.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  30.39 
 
 
417 aa  60.1  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  22.93 
 
 
829 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  26.11 
 
 
527 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  35.25 
 
 
423 aa  59.3  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  30.39 
 
 
417 aa  58.9  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  26.29 
 
 
527 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  25.69 
 
 
537 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  25.69 
 
 
551 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0289  Na+/H+ antiporter, putative  24.74 
 
 
679 aa  57.4  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  27.27 
 
 
555 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  27.31 
 
 
581 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>