More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3948 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  39.43 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  41.32 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3102  regulatory protein TetR  39.77 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0043  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  23.32 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 212 aa  52  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 193 aa  51.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  21.97 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 371 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  24.02 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 270 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  20.47 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  41.82 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  54.76 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 234 aa  48.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 250 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  19.75 
 
 		 200 aa  47.8  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  24.19 
 
 		 213 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  20.34 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  20.61 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4323  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>