277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0660 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 428 aa  868    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  73.85 
 
 		 428 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  74.33 
 
 		 428 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  72.17 
 
 		 412 aa  627  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  71.74 
 
 		 442 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  70.2 
 
 		 412 aa  610  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  69.98 
 
 		 427 aa  607  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  39.07 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  38.82 
 
 		 417 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  37.32 
 
 		 414 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  37.47 
 
 		 408 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  37.96 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  37.71 
 
 		 415 aa  259  6e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  37.32 
 
 		 415 aa  255  9e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  37.99 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  30.68 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  30.34 
 
 		 380 aa  109  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  28.44 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  29.35 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  29.81 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.71 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  28.71 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  28 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  27.5 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  26.32 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  26.32 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  27.5 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  29.82 
 
 		 270 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  25.5 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  27.48 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  28.37 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  26.25 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  27.49 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.67 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  26.25 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  28.62 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  26.25 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  25.56 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  25.61 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  26.25 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  27.56 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.6 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  29.43 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  25.44 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  28.23 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  25.75 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  27.12 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  25.4 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  27.12 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  25.59 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2561  DNA repair exonuclease-like protein  25.8 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.215391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.27 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  28.3 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  25.44 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  28.21 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  25.75 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.79 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  25.07 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  26.91 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  31.16 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  27.21 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  26.09 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  25.31 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  26.67 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  26.09 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  26.71 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.27 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  25.86 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  26.69 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  23.68 
 
 		 506 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  26.35 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  28.61 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  25.42 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  25.46 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  26.17 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  26.09 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  25.42 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.98 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  25.81 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  25.9 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  25.95 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.96 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  25.45 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  28.38 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  25.33 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.76 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  25.51 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  25.95 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2238  DNA repair exonuclease-like protein  23.59 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74733  normal  0.111488 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  25.73 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  26.8 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  25.41 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  24.65 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  25.9 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  25.17 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.7 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  26.07 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  25.17 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  25.78 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>