79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_60070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  47.89 
 
 		 762 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  100 
 
 		 807 aa  1646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  48.48 
 
 		 782 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  46.69 
 
 		 773 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.19 
 
 		 793 aa  611  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  44.34 
 
 		 780 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  49.82 
 
 		 546 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  31.95 
 
 		 784 aa  346  8e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  32.56 
 
 		 763 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  29.61 
 
 		 748 aa  330  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  30.16 
 
 		 744 aa  330  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  28.92 
 
 		 769 aa  270  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.98 
 
 		 669 aa  265  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.93 
 
 		 677 aa  263  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.93 
 
 		 677 aa  263  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  29.77 
 
 		 691 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.56 
 
 		 674 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.75 
 
 		 689 aa  230  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  26.45 
 
 		 707 aa  226  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  25.37 
 
 		 728 aa  213  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  24.97 
 
 		 714 aa  200  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  23.56 
 
 		 696 aa  169  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  31.08 
 
 		 773 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  27.02 
 
 		 623 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  33.66 
 
 		 613 aa  92  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  32.38 
 
 		 596 aa  88.2  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  31.92 
 
 		 594 aa  87.8  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  32.72 
 
 		 695 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  30.19 
 
 		 553 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  29.79 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  34.1 
 
 		 758 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  31.88 
 
 		 594 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  31.71 
 
 		 598 aa  79.7  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.28 
 
 		 637 aa  77.4  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  27.85 
 
 		 682 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  29.61 
 
 		 661 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  26.18 
 
 		 659 aa  71.6  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  29.81 
 
 		 712 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.66 
 
 		 615 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  27.78 
 
 		 703 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  26.24 
 
 		 685 aa  67.8  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  31.46 
 
 		 642 aa  65.1  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  28.93 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  29.89 
 
 		 688 aa  62.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.93 
 
 		 639 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.84 
 
 		 595 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  23.3 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  30.39 
 
 		 564 aa  57.4  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  22.75 
 
 		 674 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.01 
 
 		 640 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  29.52 
 
 		 565 aa  54.7  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.48 
 
 		 669 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.21 
 
 		 616 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25.37 
 
 		 564 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  27.37 
 
 		 657 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  26.4 
 
 		 537 aa  52.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  27.06 
 
 		 645 aa  52.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  26.26 
 
 		 634 aa  52.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.8 
 
 		 566 aa  51.6  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 645 aa  50.8  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  29.92 
 
 		 522 aa  50.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.53 
 
 		 626 aa  50.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  27.13 
 
 		 681 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  27.06 
 
 		 607 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.68 
 
 		 603 aa  48.5  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.43 
 
 		 573 aa  48.5  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  27.12 
 
 		 666 aa  48.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  26.52 
 
 		 569 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  26.52 
 
 		 569 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  27.74 
 
 		 513 aa  46.6  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.96 
 
 		 584 aa  45.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  44.19 
 
 		 347 aa  45.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  39.53 
 
 		 403 aa  45.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.08 
 
 		 589 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.48 
 
 		 591 aa  44.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.21 
 
 		 594 aa  44.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  28.04 
 
 		 515 aa  44.3  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  29.32 
 
 		 667 aa  44.3  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  36 
 
 		 626 aa  44.3  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>