99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55560 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  83.26 
 
 		 227 aa  362  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  55.17 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  38.54 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2204  hypothetical protein  40.31 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268993  normal  0.0685137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0479  secretin/TonB, short-like protein  39.8 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.084644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  35.9 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  34.57 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  35.2 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  35.22 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  32.63 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  32.16 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  42.17 
 
 		 633 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  41.84 
 
 		 815 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  46.34 
 
 		 833 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  38.55 
 
 		 817 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  30.77 
 
 		 799 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  46.05 
 
 		 778 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  38.36 
 
 		 802 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  30.37 
 
 		 815 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  41.98 
 
 		 863 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  33.33 
 
 		 804 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 864 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  44.44 
 
 		 778 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  39.73 
 
 		 804 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.46 
 
 		 833 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 823 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  35.23 
 
 		 774 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  35.14 
 
 		 812 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  35.23 
 
 		 774 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 		 774 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  35.23 
 
 		 774 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 		 774 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  37.62 
 
 		 812 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  36.11 
 
 		 801 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  36.11 
 
 		 801 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  25 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  33.77 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 816 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  33.33 
 
 		 816 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 787 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0359  TonB-dependent receptor, putative  33.77 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  38.75 
 
 		 973 aa  48.9  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 836 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  32.04 
 
 		 861 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  38.89 
 
 		 799 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  36.08 
 
 		 812 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  34.41 
 
 		 812 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  41.77 
 
 		 796 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  41.77 
 
 		 796 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  39.81 
 
 		 862 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  37.38 
 
 		 799 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  46.67 
 
 		 847 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 829 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 1188 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 798 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 		 822 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 863 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 935 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  33.7 
 
 		 813 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1018 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  41.86 
 
 		 862 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 777 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 		 814 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.8 
 
 		 789 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 		 828 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  50.79 
 
 		 819 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 800 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1967  TonB-dependent receptor plug  38.03 
 
 		 929 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.559589 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  38.1 
 
 		 518 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  36.84 
 
 		 796 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  39.24 
 
 		 867 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 782 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 809 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  33.33 
 
 		 801 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 843 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  36.25 
 
 		 1186 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  27.27 
 
 		 989 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  32.52 
 
 		 884 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 897 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 835 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  41.89 
 
 		 882 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  22.28 
 
 		 795 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 756 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4815  hypothetical protein  29.55 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  34.78 
 
 		 807 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 808 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 934 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 817 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 		 825 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  38.1 
 
 		 921 aa  42  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  38.1 
 
 		 921 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  38.1 
 
 		 881 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  38.1 
 
 		 881 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  38.1 
 
 		 881 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  39.13 
 
 		 821 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 828 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  39.64 
 
 		 827 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>