More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_41280 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  70.6 
 
 		 600 aa  859    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  100 
 
 		 610 aa  1234    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  33.22 
 
 		 595 aa  324  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  32.24 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  32.57 
 
 		 601 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  30.65 
 
 		 715 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.01 
 
 		 681 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.97 
 
 		 669 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.12 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  25.97 
 
 		 580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.11 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.55 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  25.14 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  31.18 
 
 		 478 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  24.55 
 
 		 662 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.49 
 
 		 401 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  27.25 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  25.51 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.74 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.48 
 
 		 530 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  30.83 
 
 		 513 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  30.23 
 
 		 513 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  27.1 
 
 		 513 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.42 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.78 
 
 		 342 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  25.66 
 
 		 670 aa  107  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  28.69 
 
 		 507 aa  107  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  27.85 
 
 		 658 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  21.56 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  27.47 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  21.56 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.86 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  22.47 
 
 		 1032 aa  106  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  21.8 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  22.6 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  23.26 
 
 		 514 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  22.85 
 
 		 1055 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  21.35 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  23.61 
 
 		 477 aa  104  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.02 
 
 		 497 aa  103  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  22.02 
 
 		 485 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  21.26 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  24.41 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  24.94 
 
 		 691 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  26.96 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  29.07 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  22.39 
 
 		 691 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  21.67 
 
 		 485 aa  102  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.42 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  26.53 
 
 		 431 aa  102  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  29.46 
 
 		 711 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  22.39 
 
 		 691 aa  101  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.71 
 
 		 369 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  24.69 
 
 		 691 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  24.69 
 
 		 691 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  21.56 
 
 		 485 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.7 
 
 		 524 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  24.45 
 
 		 395 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  26.04 
 
 		 633 aa  98.6  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  24.86 
 
 		 398 aa  98.6  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  24.71 
 
 		 637 aa  98.2  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  27.25 
 
 		 593 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  27.62 
 
 		 378 aa  98.2  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  27.93 
 
 		 446 aa  98.2  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  26.75 
 
 		 616 aa  97.8  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  26.19 
 
 		 391 aa  97.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  26.96 
 
 		 603 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  23.21 
 
 		 485 aa  97.1  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  25.22 
 
 		 386 aa  97.1  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  30.22 
 
 		 695 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  24.58 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  24.55 
 
 		 437 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  23.17 
 
 		 694 aa  95.1  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  23.03 
 
 		 498 aa  95.1  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.78 
 
 		 559 aa  94.7  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  23.03 
 
 		 498 aa  95.1  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  25.07 
 
 		 463 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  24.6 
 
 		 578 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  25 
 
 		 635 aa  94.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  26.2 
 
 		 778 aa  94  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  28.98 
 
 		 285 aa  94  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  26.18 
 
 		 674 aa  93.6  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  30.53 
 
 		 491 aa  93.6  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  23.89 
 
 		 345 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  24.88 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  26.64 
 
 		 395 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  22.32 
 
 		 485 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  27.51 
 
 		 511 aa  92.8  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  30.62 
 
 		 501 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  26.84 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  23.53 
 
 		 481 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  26.44 
 
 		 611 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  25.45 
 
 		 822 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  23.25 
 
 		 694 aa  92  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  23.53 
 
 		 481 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  25.81 
 
 		 464 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  25.72 
 
 		 614 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  27.37 
 
 		 481 aa  91.3  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  24.15 
 
 		 325 aa  91.3  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 630 aa  91.3  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>