More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2604 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1254 aa  2526    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1747  histidine kinase  37.11 
 
 		 1452 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.83 
 
 		 1453 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.68 
 
 		 1211 aa  413  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 516 aa  362  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4046  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.74 
 
 		 503 aa  356  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0967  histidine kinase  32.67 
 
 		 1177 aa  333  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 		 1004 aa  319  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 1295 aa  301  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  50.17 
 
 		 737 aa  290  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4044  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.48 
 
 		 652 aa  283  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 651 aa  278  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  50.35 
 
 		 1756 aa  270  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  47.26 
 
 		 588 aa  268  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4554  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 		 604 aa  262  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  47.28 
 
 		 497 aa  262  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6103  histidine kinase  49.17 
 
 		 365 aa  261  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 		 737 aa  256  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 		 604 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2944  sensor histidine kinase  48.18 
 
 		 604 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  41.02 
 
 		 1885 aa  226  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  40.19 
 
 		 471 aa  219  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  41.18 
 
 		 471 aa  218  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  42.09 
 
 		 1832 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2927  histidine kinase  31.88 
 
 		 717 aa  164  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 742 aa  155  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 933 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 807 aa  133  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 801 aa  129  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.44 
 
 		 1428 aa  128  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5522  histidine kinase  31.76 
 
 		 423 aa  128  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.989715  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 		 660 aa  125  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 		 812 aa  124  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 683 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 		 1253 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.54 
 
 		 983 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 		 982 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 893 aa  111  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0244  two component system histidine kinase  24.83 
 
 		 657 aa  111  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  42.55 
 
 		 519 aa  111  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1954  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  24.83 
 
 		 657 aa  111  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1608  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.71 
 
 		 1015 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363686 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0835  two component system histidine kinase  24.37 
 
 		 831 aa  109  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1160  putative sensor protein gacS  24.6 
 
 		 808 aa  108  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.23 
 
 		 1191 aa  108  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 		 871 aa  107  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.7 
 
 		 1309 aa  106  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 971 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0574  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.48 
 
 		 772 aa  105  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.01 
 
 		 779 aa  105  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.83 
 
 		 785 aa  105  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 760 aa  105  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 688 aa  104  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  26.03 
 
 		 955 aa  103  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 488 aa  103  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.8 
 
 		 779 aa  103  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.84 
 
 		 784 aa  103  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 900 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  23 
 
 		 1116 aa  102  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  27.08 
 
 		 794 aa  102  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 685 aa  102  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 		 885 aa  102  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0798  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.8 
 
 		 622 aa  101  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.131749 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.79 
 
 		 786 aa  101  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 		 939 aa  101  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 		 900 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 1741 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.15 
 
 		 1004 aa  99.8  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 898 aa  99.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.78 
 
 		 793 aa  99.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  25.29 
 
 		 1135 aa  99.4  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.68 
 
 		 789 aa  99.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 677 aa  99.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0924  aerobic respiration control sensor protein ArcB  23.79 
 
 		 753 aa  99  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178911  normal  0.270801 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2132  hypothetical protein  25.54 
 
 		 827 aa  98.6  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.35 
 
 		 680 aa  99  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 701 aa  98.6  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.282736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.83 
 
 		 1148 aa  98.6  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.4 
 
 		 829 aa  98.2  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1718  PAS sensor protein  25.49 
 
 		 811 aa  98.2  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.604616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 902 aa  98.2  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  32.16 
 
 		 2077 aa  97.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.24 
 
 		 765 aa  97.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 673 aa  97.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 		 1151 aa  97.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  37.14 
 
 		 433 aa  96.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.31 
 
 		 778 aa  96.3  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 681 aa  96.3  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.35 
 
 		 779 aa  96.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  24.31 
 
 		 778 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.31 
 
 		 778 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.31 
 
 		 778 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.73 
 
 		 777 aa  95.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  24.31 
 
 		 778 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 986 aa  95.5  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.31 
 
 		 778 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.95 
 
 		 711 aa  95.5  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.598881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.31 
 
 		 778 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.31 
 
 		 778 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.49 
 
 		 778 aa  95.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>