More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0600 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  36.3 
 
 		 1314 aa  678    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  51.81 
 
 		 1245 aa  1258    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  47.05 
 
 		 1297 aa  1086    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  41.68 
 
 		 1273 aa  855    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  37.95 
 
 		 1221 aa  747    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  53.36 
 
 		 1243 aa  1264    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  35.94 
 
 		 1247 aa  669    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1294 aa  2631    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 1202 aa  598  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1243 aa  565  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1302 aa  564  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1289 aa  563  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1245 aa  440  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1146 aa  303  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1134 aa  225  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 1232 aa  183  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 929 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 1149 aa  144  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1146 aa  144  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1153 aa  143  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  36.15 
 
 		 1091 aa  134  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1144 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 978 aa  105  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 980 aa  96.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 967 aa  80.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 701 aa  77  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 701 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 701 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 701 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 701 aa  76.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 694 aa  75.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 715 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 817 aa  72.4  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  26.72 
 
 		 703 aa  71.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 701 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 755 aa  69.7  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 737 aa  67  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 770 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 710 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 707 aa  65.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 743 aa  65.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 832 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 701 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 739 aa  64.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 719 aa  62.4  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 792 aa  62.4  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 727 aa  62  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 710 aa  62  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 776 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.37 
 
 		 703 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.6 
 
 		 708 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 699 aa  60.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 710 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 		 741 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 757 aa  60.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 732 aa  59.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 777 aa  59.3  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 722 aa  59.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 767 aa  58.9  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 722 aa  59.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  27.54 
 
 		 699 aa  58.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 860 aa  58.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 760 aa  58.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  22.79 
 
 		 689 aa  57.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 745 aa  57.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  26.6 
 
 		 747 aa  57.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  22.75 
 
 		 779 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  26.6 
 
 		 747 aa  57  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 747 aa  57.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 734 aa  57.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.4 
 
 		 833 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.17 
 
 		 703 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  27.03 
 
 		 747 aa  57.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 709 aa  57.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  26.6 
 
 		 747 aa  57  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.55 
 
 		 728 aa  57.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 		 732 aa  57.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  26.6 
 
 		 745 aa  57.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 735 aa  57.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 736 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 699 aa  57  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1569  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 767 aa  57.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.428413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 896 aa  57  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 748 aa  56.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 683 aa  56.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 732 aa  56.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  24.57 
 
 		 726 aa  56.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 778 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 736 aa  56.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 722 aa  56.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  26.06 
 
 		 752 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 794 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 710 aa  55.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 		 712 aa  55.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 726 aa  55.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 696 aa  55.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>