More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3943 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3943  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 382 aa  746    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2849  cystathionine gamma-synthase  67.63 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5539  Cystathionine gamma-synthase  65.79 
 
 		 390 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.904525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24950  cystathionine gamma-synthase  66.75 
 
 		 393 aa  475  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8098  Cystathionine gamma-synthase  58.25 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  41.58 
 
 		 392 aa  256  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  39.85 
 
 		 392 aa  253  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  40.82 
 
 		 396 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  39.54 
 
 		 400 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  38.99 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  40.41 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  40.15 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  39.39 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  38.95 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  40.31 
 
 		 391 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  39.19 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  39.39 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  39.95 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  35.28 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  39.59 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  38.17 
 
 		 396 aa  235  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  39.39 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  39.34 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  39.39 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  39.39 
 
 		 397 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  39.09 
 
 		 398 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  38.73 
 
 		 397 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  38.87 
 
 		 394 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  39.13 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  37.11 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  36.39 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 392 aa  229  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  38.68 
 
 		 392 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  38.83 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 392 aa  228  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  38.62 
 
 		 400 aa  228  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  38.42 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  38.17 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  40.56 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  36.36 
 
 		 383 aa  226  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.13 
 
 		 393 aa  225  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 392 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  37.66 
 
 		 392 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  37.85 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  37.66 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  37.66 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  35.62 
 
 		 399 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  40.76 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.24 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  37.44 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  38.01 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  39.55 
 
 		 398 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  34.42 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  36.22 
 
 		 386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  35.46 
 
 		 394 aa  215  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  36.41 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  40.55 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  35.97 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  35.01 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  40.82 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1981  cystathionine gamma-synthase  37.76 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  35.62 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  37.95 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  38.68 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  40.46 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  42.56 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.01 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  37.23 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  35.97 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  38.48 
 
 		 381 aa  212  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.12 
 
 		 394 aa  212  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  37.2 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  42.82 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1995  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  37.03 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  38.17 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  37.15 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  37.84 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  39.34 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  38.11 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.46 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  38.68 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.9 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.46 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  38.82 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  36.34 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  37.84 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  36.64 
 
 		 390 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.32 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  38.83 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0648  Cystathionine gamma-synthase  36.52 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  37.72 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  42.31 
 
 		 378 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  35.86 
 
 		 383 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>