More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1780 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 385 aa  767    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  57.18 
 
 		 374 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  55.53 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  55.53 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  47.1 
 
 		 1106 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  45.57 
 
 		 391 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  45.31 
 
 		 391 aa  342  5e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  47.7 
 
 		 379 aa  340  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 1171 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  46.52 
 
 		 377 aa  330  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  46.26 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  46.26 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  46.26 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  46.26 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  46.26 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  46.26 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  46.26 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  46.26 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  46.24 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  46.24 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  46.24 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  46.24 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  46.24 
 
 		 376 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  45.72 
 
 		 377 aa  326  5e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  44.32 
 
 		 379 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  46.15 
 
 		 378 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  47.57 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2513  ABC-2 type transporter  46.88 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.865231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  46.88 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  46.88 
 
 		 391 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  47.41 
 
 		 376 aa  315  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  44.99 
 
 		 384 aa  315  9e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  46.49 
 
 		 375 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  44.14 
 
 		 382 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  44.5 
 
 		 373 aa  306  6e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  44.24 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  43.67 
 
 		 379 aa  299  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  46.34 
 
 		 384 aa  295  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  43.97 
 
 		 389 aa  291  9e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  43.16 
 
 		 389 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  42.82 
 
 		 389 aa  286  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  41.55 
 
 		 368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  43.8 
 
 		 375 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  41.64 
 
 		 387 aa  276  6e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3707  ABC-2 type transporter  42.93 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  40 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  37.47 
 
 		 364 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  42.11 
 
 		 369 aa  259  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  39.21 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  38.27 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  40.05 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  39.67 
 
 		 380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  38.55 
 
 		 377 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  37.97 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  38.26 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  36.55 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 378 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  37.8 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  35.86 
 
 		 378 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  37.03 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  36.63 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  37.43 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  36.09 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  33.42 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  37.63 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 376 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  34.56 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  33.42 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  35.62 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  34.83 
 
 		 376 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  32.89 
 
 		 377 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  31.38 
 
 		 369 aa  189  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  33.91 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 		 367 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  35.41 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  30.13 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  33.62 
 
 		 379 aa  182  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  31.75 
 
 		 376 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  33.43 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  34.5 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  36.89 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 388 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  32.16 
 
 		 371 aa  179  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  31.11 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 380 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  30.13 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 380 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>