More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1797 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  100 
 
 
618 aa  1251    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  45.75 
 
 
585 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  41.8 
 
 
559 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  40.07 
 
 
585 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  37.03 
 
 
601 aa  340  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  35.07 
 
 
589 aa  335  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  34.77 
 
 
595 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  34.77 
 
 
595 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  33.93 
 
 
612 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  32.45 
 
 
591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  32.97 
 
 
611 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  33.09 
 
 
604 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2772  surface antigen (D15)  32.55 
 
 
696 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  32.97 
 
 
611 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  32.79 
 
 
604 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  32.79 
 
 
604 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  32.79 
 
 
604 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  33.33 
 
 
573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  33.33 
 
 
573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  33.33 
 
 
573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  33.15 
 
 
571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  33.15 
 
 
605 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  33.15 
 
 
605 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  33.15 
 
 
605 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  32.8 
 
 
682 aa  300  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  33.03 
 
 
605 aa  299  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  32.07 
 
 
611 aa  292  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3485  hypothetical protein  32.07 
 
 
611 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464168  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  33.22 
 
 
646 aa  251  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1090  hypothetical protein  33.1 
 
 
648 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848771  normal  0.794781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  32.41 
 
 
629 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2360  surface antigen (D15)  32.65 
 
 
636 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685865  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0857  surface antigen (D15)  31.65 
 
 
651 aa  234  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4470  surface antigen (D15)  30.58 
 
 
643 aa  229  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1592  surface antigen (D15)  29.29 
 
 
621 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1218  surface antigen (D15)  29.91 
 
 
665 aa  226  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  30.17 
 
 
634 aa  207  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  29.64 
 
 
634 aa  206  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  28.03 
 
 
640 aa  200  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  29.41 
 
 
607 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  28.27 
 
 
588 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  28.43 
 
 
555 aa  178  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  26.85 
 
 
597 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  26.23 
 
 
582 aa  173  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  27.43 
 
 
593 aa  173  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  27.27 
 
 
601 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  28.57 
 
 
603 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  27.52 
 
 
596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  28.47 
 
 
573 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  28.62 
 
 
584 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  27.5 
 
 
579 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  26.39 
 
 
558 aa  159  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  25.95 
 
 
574 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  26.03 
 
 
570 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  25.05 
 
 
583 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  26.97 
 
 
598 aa  157  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  26.78 
 
 
579 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.66 
 
 
574 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  25.77 
 
 
575 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  27.13 
 
 
575 aa  154  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  24.86 
 
 
580 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  25.8 
 
 
570 aa  153  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  27.6 
 
 
609 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  24.49 
 
 
583 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  27.72 
 
 
612 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  26.68 
 
 
629 aa  151  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  24.49 
 
 
583 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  25.64 
 
 
578 aa  150  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2126  hypothetical protein  25.65 
 
 
582 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  24.57 
 
 
609 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  26.83 
 
 
576 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  26.83 
 
 
618 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  25.45 
 
 
578 aa  146  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  25.74 
 
 
573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  27.55 
 
 
573 aa  137  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  27.06 
 
 
612 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  24.05 
 
 
578 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  26.42 
 
 
588 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  24.81 
 
 
594 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  25.13 
 
 
571 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  24.58 
 
 
578 aa  133  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  26.22 
 
 
579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  23.92 
 
 
636 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  24.96 
 
 
571 aa  130  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  25.83 
 
 
591 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  24.39 
 
 
578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  24.39 
 
 
578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  24.96 
 
 
611 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  24.74 
 
 
596 aa  128  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  24.25 
 
 
617 aa  127  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  25.57 
 
 
613 aa  124  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1915  surface antigen (D15)  22.28 
 
 
575 aa  120  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246842  normal  0.0100244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  23.96 
 
 
577 aa  120  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  24.38 
 
 
577 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  24.38 
 
 
577 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  24.38 
 
 
577 aa  118  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  24.38 
 
 
577 aa  118  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  24.38 
 
 
577 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  24.38 
 
 
577 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  24.38 
 
 
577 aa  117  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>