93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5357 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  100 
 
 		 333 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  58.33 
 
 		 308 aa  359  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  59.72 
 
 		 297 aa  349  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  60.21 
 
 		 311 aa  344  8.999999999999999e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  62.06 
 
 		 285 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  58.15 
 
 		 884 aa  335  5.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  60.69 
 
 		 297 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  60 
 
 		 297 aa  332  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  55.9 
 
 		 296 aa  318  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  55.78 
 
 		 308 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  52.17 
 
 		 301 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  56.52 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  53.61 
 
 		 309 aa  295  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  51.44 
 
 		 289 aa  281  9e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  31.62 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  29.18 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  28.71 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  28.71 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  28.38 
 
 		 341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  33.57 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  23.86 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  29.46 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  28.98 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  31.69 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  28.41 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  26.18 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  24.56 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  29.38 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  28.11 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  23.91 
 
 		 268 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  30.14 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  28.97 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 269 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 244 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  24.5 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  24.86 
 
 		 218 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 300 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 278 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25.27 
 
 		 291 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  25.63 
 
 		 279 aa  49.3  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 287 aa  49.3  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.04 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  23.36 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  28.65 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  28.74 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  24 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  30.13 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  29.83 
 
 		 392 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 289 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 273 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  23.71 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  27.01 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.52 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  23.67 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  25.61 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  24.67 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  26.32 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  28.07 
 
 		 282 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.47 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  25 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>