More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2467 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  100 
 
 		 537 aa  1052    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  46.94 
 
 		 530 aa  475  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  47.08 
 
 		 554 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  47.85 
 
 		 533 aa  472  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  46.85 
 
 		 549 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  43.44 
 
 		 522 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  44.16 
 
 		 522 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  43.44 
 
 		 522 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  43.44 
 
 		 522 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  43.24 
 
 		 522 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  43.96 
 
 		 522 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  43.81 
 
 		 522 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  47.26 
 
 		 561 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  43.24 
 
 		 522 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  44.75 
 
 		 522 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  44.95 
 
 		 522 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  47.46 
 
 		 519 aa  458  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  45.62 
 
 		 539 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  46.22 
 
 		 528 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  48.78 
 
 		 519 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  46.35 
 
 		 524 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  45.95 
 
 		 534 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  47.98 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  46.23 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  46.42 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  41.87 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  42.2 
 
 		 518 aa  356  7.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  41.31 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  37.69 
 
 		 519 aa  319  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  40.69 
 
 		 516 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  40.76 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  49.45 
 
 		 341 aa  256  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  33.64 
 
 		 567 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  30.43 
 
 		 551 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  32.04 
 
 		 558 aa  236  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  28.54 
 
 		 606 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  30.44 
 
 		 490 aa  230  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  30.12 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  31.99 
 
 		 573 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  31.98 
 
 		 663 aa  228  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  30.82 
 
 		 661 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  30.58 
 
 		 538 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  27.48 
 
 		 530 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  29.42 
 
 		 657 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  31.06 
 
 		 659 aa  223  7e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  31.06 
 
 		 659 aa  223  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  29.86 
 
 		 556 aa  221  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  30.39 
 
 		 545 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  28.92 
 
 		 637 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  30.62 
 
 		 661 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 508 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  31.13 
 
 		 678 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  31.35 
 
 		 531 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  28.55 
 
 		 568 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  30.48 
 
 		 550 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  29.14 
 
 		 506 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  30.52 
 
 		 656 aa  216  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  30.21 
 
 		 523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  32.58 
 
 		 535 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  29.35 
 
 		 644 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  30.62 
 
 		 546 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  29.49 
 
 		 520 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  29.49 
 
 		 520 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2119  betaine/carnitine/choline transporter family protein  31.37 
 
 		 524 aa  213  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  34.23 
 
 		 550 aa  213  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  32.19 
 
 		 497 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  30.34 
 
 		 584 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  27.73 
 
 		 600 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  29.31 
 
 		 542 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  28.71 
 
 		 538 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  31.73 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  34.03 
 
 		 525 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  29.48 
 
 		 503 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  32.04 
 
 		 606 aa  210  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  28.54 
 
 		 646 aa  209  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  30.62 
 
 		 548 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  30.62 
 
 		 548 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  29.23 
 
 		 530 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1851  choline/carnitine/betaine transporter  29.43 
 
 		 543 aa  208  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.993809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  29.15 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  30.4 
 
 		 558 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  32.09 
 
 		 583 aa  207  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  30.8 
 
 		 526 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  31.14 
 
 		 685 aa  207  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  30.36 
 
 		 667 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2045  choline/carnitine/betaine transporter  29.58 
 
 		 554 aa  206  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0189191  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  30.23 
 
 		 549 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  30.97 
 
 		 534 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  29.84 
 
 		 676 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  27.13 
 
 		 526 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  30.85 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  30.47 
 
 		 653 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  30.25 
 
 		 529 aa  203  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  29.18 
 
 		 671 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  32.1 
 
 		 577 aa  203  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1512  choline transport protein BetT  27.43 
 
 		 679 aa  203  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0971262  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3292  choline/carnitine/betaine transporter  27.12 
 
 		 677 aa  202  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0376  choline transport protein BetT  27.12 
 
 		 677 aa  202  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  30.53 
 
 		 498 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0373  choline transport protein BetT  27.12 
 
 		 677 aa  202  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>