248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0897 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 265 aa  520  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  47.45 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  44.89 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  43.7 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  48.37 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  43.9 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  40.25 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  35.63 
 
 		 239 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  40.44 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  35.12 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 343 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  33.07 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 315 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 249 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.74 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  42.95 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 330 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  31.89 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 252 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  32.13 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  42.96 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  36.42 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  37.41 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  31.17 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  34.17 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  40.44 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  42.74 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.51 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  30 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  29.96 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>