More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1302 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  57.92 
 
 
591 aa  702    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  53.29 
 
 
604 aa  643    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  60.48 
 
 
591 aa  740    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  52.94 
 
 
593 aa  643    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 
593 aa  669    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
602 aa  1211    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  55.38 
 
 
578 aa  639    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  52.63 
 
 
591 aa  632  1e-180  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  53.91 
 
 
589 aa  633  1e-180  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  51.1 
 
 
599 aa  627  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 
597 aa  620  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  50.59 
 
 
607 aa  605  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 
604 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  48.07 
 
 
598 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  48.07 
 
 
598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  49.07 
 
 
602 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  49.16 
 
 
598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 
598 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  47.07 
 
 
598 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  47.72 
 
 
601 aa  533  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  46.24 
 
 
597 aa  505  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  44.97 
 
 
588 aa  504  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  45.22 
 
 
594 aa  497  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  44.26 
 
 
593 aa  497  1e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  44.99 
 
 
592 aa  496  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  44.65 
 
 
589 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  45.83 
 
 
600 aa  490  1e-137  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  44.48 
 
 
592 aa  491  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  37.56 
 
 
623 aa  379  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  37.5 
 
 
1072 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  38.72 
 
 
1228 aa  357  5e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  35.34 
 
 
599 aa  355  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  37.89 
 
 
997 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  32.58 
 
 
658 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  31.15 
 
 
720 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  30.78 
 
 
1030 aa  188  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  31.36 
 
 
693 aa  188  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  29.62 
 
 
686 aa  187  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  31.36 
 
 
690 aa  187  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  29.62 
 
 
686 aa  187  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  29.45 
 
 
686 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  29.62 
 
 
686 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  29.45 
 
 
686 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  29.62 
 
 
686 aa  186  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  29.62 
 
 
686 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  29.28 
 
 
688 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  31.08 
 
 
992 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  31.08 
 
 
992 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  30.88 
 
 
834 aa  184  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  31.13 
 
 
692 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  29.11 
 
 
688 aa  184  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  34.44 
 
 
928 aa  183  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  31.25 
 
 
903 aa  183  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  29.23 
 
 
1059 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  29.57 
 
 
689 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  30.62 
 
 
705 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  30.62 
 
 
705 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  31.6 
 
 
732 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  32.08 
 
 
739 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  30.54 
 
 
927 aa  181  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  30.12 
 
 
908 aa  181  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  29.67 
 
 
1128 aa  181  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  30.97 
 
 
1183 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  31.4 
 
 
822 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  30.53 
 
 
908 aa  179  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  31.84 
 
 
686 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  30.63 
 
 
1042 aa  177  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  30.78 
 
 
1183 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 
1005 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  29.11 
 
 
1161 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  29.61 
 
 
1101 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  30.81 
 
 
692 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  32.84 
 
 
854 aa  175  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  30.51 
 
 
1113 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  30.04 
 
 
601 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  31.37 
 
 
905 aa  175  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 
1104 aa  175  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  29.8 
 
 
1124 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  32.4 
 
 
882 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  29.44 
 
 
1176 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  30.48 
 
 
882 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  29.82 
 
 
943 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  30.68 
 
 
685 aa  172  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  30.14 
 
 
856 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  31.85 
 
 
887 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  29.14 
 
 
1114 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 
1126 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  30.35 
 
 
829 aa  171  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  30.64 
 
 
903 aa  171  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  29.16 
 
 
679 aa  171  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  29.16 
 
 
679 aa  171  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  31.83 
 
 
924 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  29.35 
 
 
752 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  31.97 
 
 
879 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  29.91 
 
 
656 aa  169  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  28.68 
 
 
1038 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  29.86 
 
 
673 aa  169  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  31.87 
 
 
970 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  30.61 
 
 
774 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  30.91 
 
 
949 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>