More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0227 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  35.91 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  38.43 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  37.86 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  34.04 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 376 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 374 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  30.21 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 648 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 395 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 627 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  34.42 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  28.24 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  27.11 
 
 		 373 aa  99.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  28.99 
 
 		 360 aa  98.2  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 374 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 349 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 365 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  36.3 
 
 		 591 aa  97.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 380 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  28.57 
 
 		 362 aa  96.3  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 361 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 361 aa  95.9  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 		 390 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 359 aa  95.9  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 352 aa  95.5  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  25.61 
 
 		 407 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  26.99 
 
 		 393 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 407 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 373 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  26.77 
 
 		 365 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  28.99 
 
 		 394 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  25.65 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 		 390 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  28.37 
 
 		 395 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  28.37 
 
 		 395 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  28.37 
 
 		 395 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  28.37 
 
 		 395 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  28.37 
 
 		 395 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  28.37 
 
 		 395 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  28.37 
 
 		 395 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 		 353 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  34.15 
 
 		 1117 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  25.78 
 
 		 390 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 391 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 411 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 		 390 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 		 390 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 		 390 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  30 
 
 		 364 aa  92  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 393 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 393 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  27.64 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  26.5 
 
 		 378 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 364 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  32.89 
 
 		 1130 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  35.21 
 
 		 1134 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  35.21 
 
 		 1134 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  26.24 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 368 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  34.75 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 362 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 		 861 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 402 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 685 aa  89.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 398 aa  89  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 392 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  30.14 
 
 		 1133 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 		 1166 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 362 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  25.35 
 
 		 727 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 359 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  33.56 
 
 		 1102 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  34.9 
 
 		 1111 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 		 341 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 358 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  33.56 
 
 		 1102 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 1127 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 360 aa  85.9  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  29.79 
 
 		 368 aa  85.9  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  31.72 
 
 		 366 aa  85.9  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 336 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 		 399 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 		 399 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  29.59 
 
 		 1118 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  40.48 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  29.59 
 
 		 1120 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  29.59 
 
 		 1120 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  29.59 
 
 		 1118 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  30.97 
 
 		 1115 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  37.86 
 
 		 544 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  34.71 
 
 		 1062 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  33.92 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  29.59 
 
 		 1118 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>