More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0188 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0188  protease Do  100 
 
 		 524 aa  1029    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  70.67 
 
 		 529 aa  705    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  54.72 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  54.28 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  53.94 
 
 		 527 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  53.12 
 
 		 502 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  55.29 
 
 		 528 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  52.68 
 
 		 526 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  54.35 
 
 		 528 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  51.45 
 
 		 523 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  56.93 
 
 		 501 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  53.97 
 
 		 508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  50.69 
 
 		 520 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  57.38 
 
 		 503 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  57.17 
 
 		 503 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  54.45 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  55.88 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  55.23 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  55.24 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  52.9 
 
 		 525 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  49.91 
 
 		 537 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  46.46 
 
 		 517 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  49.42 
 
 		 520 aa  418  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  50 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  50 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  49.7 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  46.35 
 
 		 491 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  45.1 
 
 		 527 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  44.34 
 
 		 527 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  47.83 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  49.64 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  45.81 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  44.14 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  42.8 
 
 		 522 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  41.25 
 
 		 588 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  45.95 
 
 		 497 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  43.41 
 
 		 487 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  42.8 
 
 		 528 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  44.05 
 
 		 523 aa  346  6e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.71 
 
 		 483 aa  346  7e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  42.51 
 
 		 483 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  43.67 
 
 		 501 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  43.85 
 
 		 501 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  44.11 
 
 		 498 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.21 
 
 		 471 aa  342  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  45.68 
 
 		 516 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  45.36 
 
 		 508 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  44.49 
 
 		 500 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  40.37 
 
 		 524 aa  340  5e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  43.03 
 
 		 496 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  43.83 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  44.33 
 
 		 535 aa  338  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  40.3 
 
 		 524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  40.96 
 
 		 520 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  44.31 
 
 		 511 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  43.9 
 
 		 498 aa  336  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  41.09 
 
 		 514 aa  335  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  43.13 
 
 		 501 aa  334  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  45.1 
 
 		 501 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  44.62 
 
 		 511 aa  333  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  46.03 
 
 		 499 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  44.62 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  44.92 
 
 		 497 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  41.33 
 
 		 506 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  41.54 
 
 		 493 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  49.36 
 
 		 524 aa  329  9e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  47.8 
 
 		 578 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.06 
 
 		 493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  45.65 
 
 		 498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  43.13 
 
 		 485 aa  320  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  40.76 
 
 		 515 aa  317  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  45.19 
 
 		 457 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.16 
 
 		 501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  43.68 
 
 		 499 aa  310  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  41.13 
 
 		 502 aa  309  9e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  46.27 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  41.11 
 
 		 462 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.34 
 
 		 475 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  43.44 
 
 		 476 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  41.24 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  45.12 
 
 		 466 aa  300  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  44.01 
 
 		 458 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  41.06 
 
 		 524 aa  293  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  40.26 
 
 		 481 aa  292  9e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.67 
 
 		 473 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  40.55 
 
 		 497 aa  290  3e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  39.15 
 
 		 510 aa  290  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  39.92 
 
 		 482 aa  290  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  44.16 
 
 		 485 aa  289  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  43.1 
 
 		 480 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.19 
 
 		 476 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  37.55 
 
 		 496 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  38.61 
 
 		 464 aa  286  5.999999999999999e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  42.11 
 
 		 477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  42.11 
 
 		 477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  37.63 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  38.4 
 
 		 473 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  38.64 
 
 		 473 aa  282  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  40.15 
 
 		 478 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  41.22 
 
 		 489 aa  279  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>