78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1421 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  52.28 
 
 		 614 aa  671    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  100 
 
 		 611 aa  1261    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  34.76 
 
 		 660 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  35.25 
 
 		 659 aa  335  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  34.8 
 
 		 610 aa  335  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  33.44 
 
 		 720 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  34.79 
 
 		 659 aa  326  7e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  34.32 
 
 		 661 aa  322  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  34.64 
 
 		 655 aa  319  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  33.8 
 
 		 663 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  31.96 
 
 		 652 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  33.81 
 
 		 659 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  33.59 
 
 		 663 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  31.42 
 
 		 662 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  29.97 
 
 		 712 aa  296  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  30.15 
 
 		 674 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  31.62 
 
 		 678 aa  287  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  32.61 
 
 		 668 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  31.02 
 
 		 678 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  31.36 
 
 		 672 aa  279  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  30.69 
 
 		 661 aa  279  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  29.67 
 
 		 686 aa  273  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  32.19 
 
 		 675 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  30.39 
 
 		 657 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  29.47 
 
 		 681 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  30.39 
 
 		 657 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  29.66 
 
 		 672 aa  265  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  30.28 
 
 		 651 aa  264  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  29.39 
 
 		 687 aa  262  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  29.7 
 
 		 672 aa  261  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  32.03 
 
 		 693 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  32.43 
 
 		 692 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  29.73 
 
 		 657 aa  256  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  31.27 
 
 		 693 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.44 
 
 		 659 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  30.05 
 
 		 641 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.79 
 
 		 662 aa  244  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  29.14 
 
 		 660 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  30 
 
 		 658 aa  238  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.84 
 
 		 651 aa  207  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  30.29 
 
 		 565 aa  204  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.59 
 
 		 656 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.6 
 
 		 1433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  23.52 
 
 		 1526 aa  79.3  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  23.4 
 
 		 1537 aa  75.5  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  21.38 
 
 		 1593 aa  63.9  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.65 
 
 		 725 aa  60.8  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.14 
 
 		 760 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.21 
 
 		 720 aa  58.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.34 
 
 		 741 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.61 
 
 		 757 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.67 
 
 		 700 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  21.87 
 
 		 758 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.08 
 
 		 868 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.32 
 
 		 708 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.54 
 
 		 759 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  23.82 
 
 		 757 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  24.87 
 
 		 675 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.87 
 
 		 776 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.87 
 
 		 776 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.73 
 
 		 711 aa  49.3  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.6 
 
 		 770 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.78 
 
 		 720 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  24.6 
 
 		 770 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.6 
 
 		 797 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2754  protein of unknown function DUF608  30.43 
 
 		 661 aa  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.76 
 
 		 723 aa  47.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.39 
 
 		 721 aa  47.4  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  25.26 
 
 		 758 aa  47  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.2 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.98 
 
 		 723 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  23.13 
 
 		 715 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.32 
 
 		 734 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.48 
 
 		 736 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.95 
 
 		 741 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.3 
 
 		 746 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  21.91 
 
 		 727 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  23.81 
 
 		 706 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>