More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4571 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  100 
 
 		 525 aa  1027    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  62.1 
 
 		 518 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  45.63 
 
 		 522 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  44.74 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  36.83 
 
 		 508 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  36.33 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  34.59 
 
 		 502 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  36.04 
 
 		 502 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  34.89 
 
 		 499 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  33.52 
 
 		 521 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  35.62 
 
 		 522 aa  226  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  33.96 
 
 		 543 aa  220  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  33.84 
 
 		 521 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.28 
 
 		 598 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.06 
 
 		 595 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.72 
 
 		 588 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 597 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.27 
 
 		 568 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  35.01 
 
 		 647 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.29 
 
 		 568 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 626 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 		 647 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  34.11 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.54 
 
 		 648 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.89 
 
 		 634 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  34.86 
 
 		 642 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.58 
 
 		 631 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.77 
 
 		 647 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  30.55 
 
 		 527 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  36.07 
 
 		 652 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.56 
 
 		 658 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.66 
 
 		 738 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.7 
 
 		 622 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  43.68 
 
 		 622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.28 
 
 		 643 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.86 
 
 		 596 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.9 
 
 		 624 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.04 
 
 		 723 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  31.51 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 		 594 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  34.31 
 
 		 784 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.61 
 
 		 746 aa  146  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  30.69 
 
 		 603 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.83 
 
 		 629 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.63 
 
 		 736 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.07 
 
 		 769 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  25.46 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  29.11 
 
 		 607 aa  139  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  33.51 
 
 		 686 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.33 
 
 		 757 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  29.5 
 
 		 581 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.24 
 
 		 582 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 		 664 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 470 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  28.73 
 
 		 531 aa  130  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 644 aa  125  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  28.81 
 
 		 667 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.08 
 
 		 798 aa  123  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.67 
 
 		 619 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  38.42 
 
 		 646 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  33.19 
 
 		 605 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 584 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  37.1 
 
 		 608 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  29.64 
 
 		 606 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 580 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  28.45 
 
 		 600 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 636 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  28.65 
 
 		 605 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 		 821 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  49.56 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  49.56 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  49.56 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  28.17 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  29.19 
 
 		 603 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  51.04 
 
 		 413 aa  99.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  25.74 
 
 		 375 aa  99.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  48 
 
 		 409 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 584 aa  96.7  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.1 
 
 		 737 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  48.45 
 
 		 436 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  30.83 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  41.84 
 
 		 584 aa  80.9  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.34 
 
 		 878 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 906 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.56 
 
 		 822 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  43.14 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  42.16 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0100  hypothetical protein  23.63 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 712 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4558  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  31.16 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0539  hypothetical protein  30.92 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  39.22 
 
 		 956 aa  74.3  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 1020 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  25.97 
 
 		 584 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 922 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4743  transcriptional regulator, CadC  34.92 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.274982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.38 
 
 		 878 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  40.82 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  34.82 
 
 		 945 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2919  transcriptional regulatory protein-like protein  34.38 
 
 		 604 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>