More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2686 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2686  LuxR family regulatory protein  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3282  LuxR family transcriptional regulator  77.66 
 
 		 202 aa  304  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2463  LuxR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 423 aa  221  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2762  transcriptional regulator, LuxR family  52.27 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1268  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 181 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.550511  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3273  LuxR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1152  LuxR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1564  LuxR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1365  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4609  LuxR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 181 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187636  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1551  LuxR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1109  LuxR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0705073  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0949  LuxR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.359362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1876  LuxR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0214  LuxR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231548  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2609  LuxR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1723  sensory box transcriptional regulator  51.14 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1698  PAS  51.14 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1442  LuxR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1785  LuxR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0982  LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1464  LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1984  transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 181 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1654  transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 181 aa  177  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00914552  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1389  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 181 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1349  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 181 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2659  putative PAS/PAC sensor protein  48.04 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1569  putative transcription regulator protein  47.16 
 
 		 181 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1904  LuxR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3128  LuxR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1761  transcriptional regulator, LuxR family  46.29 
 
 		 181 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1960  LuxR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 181 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2636  LuxR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4267  LuxR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 180 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1985  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3263  transcriptional regulator, LuxR family  43.32 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1455  LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231735  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1516  LuxR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300196  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22220  Transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3436  LuxR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5257  LuxR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272579  normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4682  putative PAS/PAC sensor protein  35.47 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.706561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.23 
 
 		 756 aa  72  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1478  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.23 
 
 		 740 aa  72  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2620  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.24 
 
 		 743 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116694  normal  0.658047 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1579  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.83 
 
 		 1093 aa  68.6  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.260436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3192  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.73 
 
 		 736 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4922  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.82 
 
 		 617 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.051397 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 940 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.67 
 
 		 1193 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3296  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1438  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 1007 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  27.43 
 
 		 516 aa  58.2  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  36.84 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4873  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.83 
 
 		 704 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.924462  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  51.92 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  40.7 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3602  LuxR response regulator receiver  41.18 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.66617  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  45.28 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2343  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999882  normal  0.0841394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  49.06 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0164  diguanylate cyclase  30.63 
 
 		 437 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.890841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4877  PAS sensor protein  51.92 
 
 		 643 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.35 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  44.23 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5362  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 643 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 496 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1065  two component LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1784  response regulator  42.42 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1707  sensory box-containing diguanylate cyclase, putative  38.46 
 
 		 1057 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1955  response regulator  42.42 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1521  response regulator  42.42 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410508 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1500  response regulator  42.42 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000401264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0027  DNA-binding transcriptional activator UhpA  47.27 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 510 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0851  DNA-binding response regulator  45.28 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464733  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2771  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3175  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 148 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5418  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 774 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 510 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3104  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.43 
 
 		 700 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>