More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5329 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  58.21 
 
 		 594 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  100 
 
 		 586 aa  1124    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  57.32 
 
 		 594 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  58.04 
 
 		 594 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  58.39 
 
 		 594 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  58.39 
 
 		 594 aa  643    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  58.39 
 
 		 594 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  57.86 
 
 		 594 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  58.39 
 
 		 594 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  57.24 
 
 		 950 aa  628  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  57.19 
 
 		 594 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  56.25 
 
 		 594 aa  628  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  57.27 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  57.27 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  57.27 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  57.27 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  55.89 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  57.27 
 
 		 594 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  57.27 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  57.27 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  56.06 
 
 		 589 aa  621  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  55.27 
 
 		 590 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  53.58 
 
 		 593 aa  612  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  57.75 
 
 		 590 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  58.38 
 
 		 590 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  55.2 
 
 		 589 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  54.94 
 
 		 604 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  54.95 
 
 		 617 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  54.86 
 
 		 608 aa  598  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  54.86 
 
 		 608 aa  598  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  54.94 
 
 		 597 aa  598  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  51.9 
 
 		 598 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  55.52 
 
 		 589 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  55.46 
 
 		 613 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  53.21 
 
 		 951 aa  579  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  51.17 
 
 		 599 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  55.97 
 
 		 608 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  52.77 
 
 		 597 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  53.5 
 
 		 588 aa  558  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  55.71 
 
 		 608 aa  547  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  51.16 
 
 		 630 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  53.26 
 
 		 631 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  52.65 
 
 		 595 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  49.57 
 
 		 589 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  51.95 
 
 		 954 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  53.01 
 
 		 604 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  54.28 
 
 		 625 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  47.5 
 
 		 583 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 589 aa  501  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  49.29 
 
 		 590 aa  480  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.3 
 
 		 596 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  38.7 
 
 		 599 aa  324  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  34.36 
 
 		 663 aa  316  9e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  36.56 
 
 		 614 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  41.33 
 
 		 823 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  41.33 
 
 		 823 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  39.97 
 
 		 608 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 611 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  41.28 
 
 		 827 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  38.78 
 
 		 612 aa  294  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  32.28 
 
 		 643 aa  292  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  37.67 
 
 		 593 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  32.97 
 
 		 648 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  36.59 
 
 		 593 aa  290  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  33.86 
 
 		 647 aa  287  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  36.27 
 
 		 593 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  40.52 
 
 		 822 aa  276  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  38.45 
 
 		 611 aa  276  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  35.45 
 
 		 606 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 610 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  35.32 
 
 		 616 aa  273  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  38.03 
 
 		 832 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  36.21 
 
 		 606 aa  272  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  31.28 
 
 		 643 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  32.32 
 
 		 646 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  33.51 
 
 		 582 aa  266  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  40.27 
 
 		 828 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.67 
 
 		 646 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  35.16 
 
 		 624 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  36.47 
 
 		 830 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  34.61 
 
 		 660 aa  256  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  37.19 
 
 		 852 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  33.94 
 
 		 842 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  33.81 
 
 		 678 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  34.08 
 
 		 679 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 563 aa  253  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  32.5 
 
 		 603 aa  252  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  35.08 
 
 		 652 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  35.08 
 
 		 652 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  34.13 
 
 		 652 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  32.29 
 
 		 682 aa  247  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  33.69 
 
 		 616 aa  243  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 256 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  50.39 
 
 		 276 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  31.89 
 
 		 632 aa  236  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  32.17 
 
 		 565 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  33.33 
 
 		 621 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  47.93 
 
 		 257 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  46.83 
 
 		 257 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  34.9 
 
 		 840 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>