More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1936 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3999  phytase  54.07 
 
 		 1844 aa  793    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 1016 aa  1981    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  63.75 
 
 		 672 aa  458  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  61.03 
 
 		 396 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.49 
 
 		 424 aa  402  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.18 
 
 		 457 aa  396  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  50.94 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  54.08 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.81 
 
 		 396 aa  369  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.84 
 
 		 447 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  52.12 
 
 		 705 aa  348  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.78 
 
 		 391 aa  322  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  49.45 
 
 		 419 aa  321  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  44.2 
 
 		 394 aa  319  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.21 
 
 		 394 aa  316  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  44.54 
 
 		 396 aa  309  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  44.36 
 
 		 404 aa  309  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.72 
 
 		 398 aa  306  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  45.05 
 
 		 394 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.16 
 
 		 401 aa  287  7e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  42.89 
 
 		 410 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  48.76 
 
 		 410 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  48.76 
 
 		 410 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  41.04 
 
 		 379 aa  239  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  54.76 
 
 		 615 aa  233  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  39.6 
 
 		 384 aa  233  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  54.58 
 
 		 980 aa  233  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  34.98 
 
 		 454 aa  230  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  40.11 
 
 		 354 aa  226  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  42.3 
 
 		 390 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  54.22 
 
 		 526 aa  227  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  34.08 
 
 		 454 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  54.58 
 
 		 460 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  40.05 
 
 		 472 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  35.75 
 
 		 399 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.87 
 
 		 2668 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  38.27 
 
 		 350 aa  211  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  35.56 
 
 		 463 aa  210  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  36.24 
 
 		 464 aa  208  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  49.44 
 
 		 341 aa  207  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  50.78 
 
 		 341 aa  205  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  38.15 
 
 		 384 aa  202  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  40.11 
 
 		 383 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.84 
 
 		 383 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  48.54 
 
 		 686 aa  194  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  36.64 
 
 		 374 aa  194  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  43.08 
 
 		 460 aa  191  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  47.27 
 
 		 2105 aa  190  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  33.42 
 
 		 376 aa  190  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.6 
 
 		 1795 aa  188  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  37.92 
 
 		 388 aa  187  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.78 
 
 		 1236 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  45.95 
 
 		 363 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  35.96 
 
 		 387 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3763  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.01 
 
 		 341 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40.96 
 
 		 2667 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  36.87 
 
 		 381 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  34.6 
 
 		 389 aa  167  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  37.7 
 
 		 2775 aa  162  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  45.96 
 
 		 2885 aa  152  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  40.14 
 
 		 1712 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  34.32 
 
 		 404 aa  150  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  47.55 
 
 		 1279 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  32.69 
 
 		 345 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  40.64 
 
 		 757 aa  144  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  33.78 
 
 		 404 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  43.15 
 
 		 260 aa  142  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  47.37 
 
 		 946 aa  140  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 		 491 aa  139  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.48 
 
 		 588 aa  138  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  34.67 
 
 		 401 aa  137  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.82 
 
 		 279 aa  135  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  41.2 
 
 		 9867 aa  134  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.17 
 
 		 1164 aa  134  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.92 
 
 		 1534 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  46.03 
 
 		 1287 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  41.48 
 
 		 1424 aa  131  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.09 
 
 		 3427 aa  131  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  41.13 
 
 		 1532 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  44.62 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  44.62 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  43.59 
 
 		 1895 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  40.23 
 
 		 4334 aa  127  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  43.88 
 
 		 1383 aa  126  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.33 
 
 		 2678 aa  125  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  39.75 
 
 		 595 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.71 
 
 		 1963 aa  124  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.67 
 
 		 219 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  39.33 
 
 		 982 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  42.23 
 
 		 5171 aa  122  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  44.25 
 
 		 2954 aa  122  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  38.46 
 
 		 833 aa  122  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  43.46 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  48.39 
 
 		 561 aa  120  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  38.96 
 
 		 3619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  39.9 
 
 		 3954 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  40.68 
 
 		 795 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  45.18 
 
 		 1363 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  38.53 
 
 		 3619 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  46.91 
 
 		 606 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>