94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2412 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  100 
 
 		 277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  27.23 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  26.04 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.43 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  28.95 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  27.51 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  28.15 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  26.94 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  28.57 
 
 		 447 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  28.12 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  25.77 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  30.08 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  29.75 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  32.2 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  26.2 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  29.84 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  21.98 
 
 		 218 aa  52.8  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  26.32 
 
 		 237 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  30.4 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  50 
 
 		 693 aa  52.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  29.33 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  21.18 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  25.67 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  28.57 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  35.29 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  30.81 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  28.28 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  26.97 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  34.33 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1370  LmbE-like protein  27.54 
 
 		 204 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.525647  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  28.91 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  30 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  28.57 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  24.73 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  25.42 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  28.81 
 
 		 221 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  30.7 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  25.14 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  39.24 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  26.88 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  32.69 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  25.75 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  23.41 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  25.99 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  25.86 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  43.28 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  43.28 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  26.5 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  21.35 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  25.81 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  25.42 
 
 		 193 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  23.08 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  24.02 
 
 		 238 aa  45.8  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  26.26 
 
 		 225 aa  45.4  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  36.23 
 
 		 462 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  32.53 
 
 		 464 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  25.25 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  22.95 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  47.62 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  20.72 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  21.69 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  25.27 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  21.69 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  34.57 
 
 		 469 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  31.67 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  25 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  21.69 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  21.69 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  21.69 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  25.26 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  21.69 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  28.48 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  21.98 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  26.32 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  24.58 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  38 
 
 		 642 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  24.17 
 
 		 213 aa  43.5  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.94 
 
 		 642 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  28.45 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  23.85 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  30 
 
 		 359 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  48.72 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  43.9 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  21.16 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  25.13 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  25.48 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  31.09 
 
 		 218 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  24.32 
 
 		 242 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  21.69 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  33.33 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  26.09 
 
 		 239 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  28.23 
 
 		 260 aa  42  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  25.79 
 
 		 245 aa  42  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>