171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1772 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1772  chymotrypsin serine protease  100 
 
 
259 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00326705 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0142  chymotrypsin serine protease  84.23 
 
 
260 aa  454  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0833  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  83.33 
 
 
257 aa  447  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0164  chymotrypsin serine protease  79.07 
 
 
257 aa  432  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00504821  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1770  chymotrypsin serine protease  68.46 
 
 
260 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00353652 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0140  chymotrypsin serine protease  62.84 
 
 
261 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  32.18 
 
 
525 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  30 
 
 
523 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  29.47 
 
 
523 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  28.57 
 
 
526 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4410  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.82 
 
 
584 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  29.89 
 
 
516 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  31.84 
 
 
497 aa  55.5  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3947  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.24 
 
 
541 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889809  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  31.25 
 
 
520 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  30.54 
 
 
502 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  30.59 
 
 
518 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  29.94 
 
 
510 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  29.27 
 
 
504 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  29.41 
 
 
509 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0855  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.9 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0900  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.9 
 
 
301 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.38111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.65 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.69 
 
 
752 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0248292 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.98 
 
 
507 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0904  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.9 
 
 
301 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313384  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  28.04 
 
 
373 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  29.24 
 
 
483 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  28.14 
 
 
528 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  29.24 
 
 
483 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  30 
 
 
517 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  28.74 
 
 
388 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  30.72 
 
 
493 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  28.4 
 
 
501 aa  49.7  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  28.57 
 
 
528 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  28.05 
 
 
506 aa  49.7  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  30.72 
 
 
506 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  28.99 
 
 
520 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  30.59 
 
 
479 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  30.59 
 
 
492 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  29.21 
 
 
483 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  30.59 
 
 
477 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  25.83 
 
 
476 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  30.77 
 
 
473 aa  48.9  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  29.7 
 
 
505 aa  48.9  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.74 
 
 
439 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1343  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  27.47 
 
 
536 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.937553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.29 
 
 
674 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.49 
 
 
474 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  30.18 
 
 
511 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  27.84 
 
 
509 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  29.76 
 
 
391 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  27.33 
 
 
487 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  30.95 
 
 
467 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  29.28 
 
 
464 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  26.49 
 
 
474 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.49 
 
 
474 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  30 
 
 
477 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  29.82 
 
 
527 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  28.99 
 
 
482 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  30.39 
 
 
308 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  29.82 
 
 
527 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  28.21 
 
 
383 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  27.96 
 
 
501 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  28.57 
 
 
453 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3867  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.84 
 
 
433 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  28.57 
 
 
506 aa  46.6  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  29.65 
 
 
491 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  27.27 
 
 
514 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3996  hypothetical protein  26.6 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.41 
 
 
426 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  27.37 
 
 
458 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2023  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.89 
 
 
537 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.56 
 
 
280 aa  46.2  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  27.37 
 
 
457 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  27.51 
 
 
357 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  27.71 
 
 
527 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2598  trypsin family protein  27.22 
 
 
344 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  27.81 
 
 
397 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  25.68 
 
 
501 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  27.81 
 
 
397 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3211  predicted protein  25 
 
 
331 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  28.74 
 
 
491 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  27.81 
 
 
477 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  28.74 
 
 
482 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  25.93 
 
 
471 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  27.54 
 
 
537 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  27.06 
 
 
379 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  28.82 
 
 
490 aa  45.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  27.32 
 
 
481 aa  45.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
403 aa  45.8  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  28.82 
 
 
476 aa  45.4  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  28.05 
 
 
529 aa  45.4  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.88 
 
 
544 aa  45.4  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  23.96 
 
 
485 aa  45.4  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  26.06 
 
 
488 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  31.4 
 
 
515 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.06 
 
 
379 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  29.65 
 
 
524 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.01 
 
 
428 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>