More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0008 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0008  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.508518  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  38.55 
 
 		 1694 aa  104  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 543 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 1094 aa  99.4  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 		 1276 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 711 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 3560 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.91 
 
 		 836 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 452 aa  87.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 3035 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 4489 aa  86.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 602 aa  85.9  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.76 
 
 		 397 aa  85.5  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 927 aa  84.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.18 
 
 		 784 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 4079 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.9 
 
 		 707 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 740 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 662 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  33.93 
 
 		 573 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.85 
 
 		 1979 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 955 aa  79  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 636 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.79 
 
 		 292 aa  78.2  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  31.5 
 
 		 745 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.63 
 
 		 576 aa  78.2  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 562 aa  78.2  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  35.84 
 
 		 560 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.21 
 
 		 730 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  30.38 
 
 		 635 aa  77.4  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.24 
 
 		 1007 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 512 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 467 aa  74.7  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  32.87 
 
 		 1138 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  34.04 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.98 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1069 aa  72.8  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 		 818 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 591 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.03 
 
 		 715 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.66 
 
 		 1022 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.05 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.05 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 		 784 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 716 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 465 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.71 
 
 		 565 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.07 
 
 		 742 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 878 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.57 
 
 		 1056 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1038 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 687 aa  67  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 935 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 699 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.11 
 
 		 1056 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.11 
 
 		 988 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  24.78 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 761 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  30.43 
 
 		 743 aa  65.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 523 aa  65.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  32.33 
 
 		 1154 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 367 aa  65.5  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  28.47 
 
 		 615 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 602 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.49 
 
 		 887 aa  65.5  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 767 aa  65.1  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 617 aa  64.7  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.3 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 414 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1049 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  29.75 
 
 		 299 aa  64.7  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.73 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.03 
 
 		 623 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.88 
 
 		 810 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 732 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 589 aa  63.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.82 
 
 		 739 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 1737 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.73 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>